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2024年5月1日发(作者:golang socket编程)
第
27
卷第
2
期
圆园23
年
4
月
生命科学研究
蕴蚤枣藻杂糟蚤藻灶糟藻砸藻泽藻葬则糟澡
灾燥造援27晕燥援2
Apr.圆园23
DOI:10.16605/.1007-7847.2021.06.0171
生物信息学
窑窑
多数据库联合探究
TEKT2
在卵巢癌中的作用
(青海大学附属医院,中国青海西宁810012)
摘要
:
为了探讨筑丝蛋白2(tektin2,TEKT2)在卵巢癌(ovariancancer,OV)中的表达情况、临床意义及功能机
制,为OV的早期诊断和治疗提供新思路,本研究通过多个数据库的联合运用探讨TEKT2在OV中的作用。首
先,应用GEPIA2数据库分析TEKT2在OV中的表达情况,同时使用GEPIA2数据库
、
TIMER数据库和Ka-
plan-Meier绘图平台探究TEKT2在OV中的预后价值;其次,采用Pearson分析探究TEKT2与肿瘤蛋白53
(tumorprotein53,TP53)在OV中的相关性,并且基于Kaplan-Meier绘图平台探究TEKT2预后价值与TP53突
变类型的关系;再次,通过TIMER数据库分析TEKT2与免疫细胞的相关性;最后,实时聚合酶链反应(re-
al-timePCR)被用来验证
TEKT
2在OV细胞中的表达,细胞增殖毒性检测(CCK-8)被用来评估TEKT2与OV
细胞增殖的关系。结果显示:
TEKT
2在OV中高表达,与OV患者的预后较好相关,且是一个独立预后因素;在
OV患者中,TEKT2与TP53的表达呈正相关,并且在野生型TP53患者中,TEKT2具有预后价值;TEKT2的高
表达与巨噬细胞和中性粒细胞密切相关,其中TEKT2的臂水平缺失与中性粒细胞的浸润显著相关。进一步的
CCK-8实验结果表明,TEKT2可抑制OV细胞的增殖。上述研究提示,TEKT2可能通过调节免疫细胞的浸润
和抑制OV细胞的增殖影响OV患者预后
。
关键词
:
筑丝蛋白-2(TEKT2);卵巢癌(OV);预后分析;免疫细胞浸润;细胞增殖;生物信息学
中图分类号
:
Q811.4,R737文献标志码
:
A文章编号
:
1007-7847(2023)02-0170-09
袁美莉
,
李妍
,
赵亮
*
ExplorationoftheRoleofTEKT2inOvarianCancerby
CombinationofMultipledatabases
Abstract:Toinvestigatetheexpression,clinicalsignificanceandfunctionalmechanismoftektin2(TEKT2)
inovariancancer(OV),andprovidenewideasinearlydiagnosisandtreatmentofOV,multipledatabaseswere
y,theexpressionofTEKT2intheOVtissuewas
gnosticvalueofTEKT2inpatientswithOVwasexploredby
ly,thecorrelationbetweenTEKT2andtu原
morprotein53(TP53)inOVwasexploredbyPearsoncorrelationanalysis,andtherelationbetweenTEKT2
prognoy,thecorrelation
y,theexpressionofTEKT2in
OVcellswasverifiedbyrealtime-PCR,andtheeffectofTEKT2ontheproliferationofOVcellswasevalua-
tedusingCellCountingKit-8(CCK-8).TheresultsshowedthatTEKT2washighlyexpressedinOVtissue,
whichwasrelatedtoagoodprognosisofOVpatients,
OVpatients,TEKT2waspositivelycorrelatedwiththeexpressionofTP53,andinwild-typeTP53patients,
pressionofTEKT2wascloselyrelatedtomacrophagesandneutrophils,
inwhichobviouscorrelation
importantly,lusion,this
studyfoundthatTEKT2mayaffecttheprognosisofOVpatientsbyregulatingimmunecellinfiltrationand
收稿日期
:2021-06-10;
修回日期
:2021-08-22;
网络首发日期
:2023-03-29
作者简介
:袁美莉(1989—),女,青海西宁人,硕士研究生;
*
通信作者:赵亮(1987—),女,青海西宁人,主治医师,主要从事妇科肿瘤基
础研究,E-mail:****************。
(QinghaiUniversityAffiliatedHospital,Xining810012,Qinghai,China)
YUANMeili,LIYan,ZHAOLiang
*
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第
2
期
袁美莉等:多数据库联合探究
TEKT2
在卵巢癌中的作用
171
inhibitingOVcellproliferation.
Keywords:tektin2(TEKT2);ovariancancer(OV);prognosticanalysis;immunecellinfiltration;cellproli-
feration;bioinformatics
(LifeScienceResearch,2023,27(2):170-178)
卵巢癌
(ovariancancer,OV)
是女性生殖系统
肿瘤中恶性程度较高的肿瘤之一
[1]
,
致死率约为
47.4%,
主要原因是早期诊断率较低
,
据统计
,
大
约
70%
的
OV
被确诊时已经处于晚期
[2]
。手术切
除、细胞减灭术和铂
-
紫杉烷联合化疗是
OV
治疗
随着
OV
治疗方法的不断改善
,
在最常用的方法
[3]
。
过去的
30
年
,OV
患者的生存率提高了约
20%
[4]
。
研究显示
,
血管内皮生长因子
(vascularendothelial
聚腺苷二磷酸核糖聚合酶
growthfactor,VEGF)
、
(polyADP-ribosepolymerase,PARP)
和
PI3K/Akt/
mTOR
信号通路等可促进
OV
细胞增殖和转移
[5-7]
。
目前
,
针对这些关键分子和通路的靶向治疗药物
已经应用于临床
,
然而
OV
的发生和发展是多种
分子相互调控导致的
,
其具体分子机制尚未被完
全阐明。因此
,
发现新的生物标志物对于
OV
的机
制探究和治疗仍至关重要
。筑丝蛋白
2(tektin2,
TEKT2)
属于筑丝蛋白家族成员
,
是一种纤维形成
蛋白质
,
最早被发现可与微管蛋白形成鞭毛
,
可
能与精子发生过程相关
[8]
。相关研究表明
,TEKT2
不仅参与精子运动
,
而且与癫痫和内耳发育异常
关系密切
[9-10]
。目前
,
关于
TEKT2
在肿瘤中的作用
很少有研究报道
。
本研究从多个角度探究了
TEKT2
在
OV
中
的作用
,
包括
:
应用多种数据库分析
TEKT2
的表
达情况、预后价值、治疗靶点相关性和免疫相关性
;
应用实时聚合酶链反应
(real-timePCR)
验证
TEKT2
在
OV
细胞中的表达
;
采用细胞增殖毒性检测
(CCK-8)
实验分析
TEKT2
对
OV
细胞增殖的调节
作用。本研究首次证明了
TEKT2
在
OV
中的作用
,
为
OV
分子机制的探究和治疗提供了理论依据。
基因的差异表达分析
。在该研究中
,
我们基于
lim-
ma
分析
,
应用
GEPIA2
平台对
TEKT2
在多种肿
瘤组织和相应正常组织之间的表达情况进行分
析
,P<0.05
为表达具有显著差异。
1.1.2TEKT2的预后分析
Kaplan-Meier
绘图平台
[12]
(/
analysis/,2021-04-20)
能够评估
5
万多个基因在
21
种癌症类型的预后价值
。本文基于
Kaplan-
Meier
绘图平台自带的
Kaplan-Meier
生存分析工
具探究
TEKT2
在
OV
中的预后价值。
TIMER
数据
库
[13]
主要是一个基于
RNA-seq
数据评估免疫细
胞浸润的工具
,
其也可对基因进行差异表达分析
和预后分析。在
该研究中
,
我们应用
TIMER
和
GEPIA2
进一步验证
TEKT2
的预后价值
,
并应用
TIMER
对
TEKT2
在包括
OV
在内的多种肿瘤中
的预后价值进行分析
。
1.1.3TEKT2预后价值的Cox回归分析
影响肿瘤患者预后的因素并不是单一的
,
因
此在探究肿瘤预后影响因素的过程中
,
确定一个
因素是否为独立预后因素至关重要。为了确定
TEKT2
是否为
OV
的独立预后因素
,
我们对年龄
、
种族、肿瘤纯度、
B
细胞、
CD8
+
T
细胞、
CD4
+
T
细胞、
中性粒细胞、树突状细胞和
TEKT2
进行了单因素、
多因素
Cox
回归分析。具体操作
:
在
TIMER
在线
工具中纳入可能影响
OV
预后的因素
,
然后基于
TCGA
数据库中的基因测序数据和临床数据进行
Cox
回归分析。
1.1.4
析
TEKT2与TP53在OV中表达的相关性分
1材料与方法
1.1数据库分析
1.1.1TEKT2在肿瘤组织和癌旁组织中的差异
表达分析
GEPIA2
[11]
(/,2021-
04-20)
平台包括来自
TCGA
和
GTEx
数据库的
9736
个肿瘤组织和
8587
个正常组织的
RNA
测
序
(RNA-seq)
数据
,
可对肿瘤和正常组织样本进行
肿瘤蛋白
53(tumorprotein53,TP53)
高突变
率是
OV
的分子特征
,
可驱动
OV
的发生
[14]
。在该
研究中
,
我们选用
Pearson
相关性分析探究
TEKT2
的表达与
TP53
的表达在
OV
中的相关性。
P<0.05
被视为具有相关性
,
统计分析通过
R
语言实现。
1.1.5TEKT2与免疫细胞的相关性分析
免疫细胞浸润的改变既可以促进
OV
的发
生
,
又与
OV
细胞的侵袭和转移密切相关
[15-16]
。因
此
,
分析肿瘤微环境的变化对于肿瘤分子机制的
探究有着重要的意义。
TIMER
数据库不仅可以分
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172
生命科学研究
圆园23
年
析免疫细胞的浸润丰度
,
而且提供了大量的拷贝
数变异数据。我们基于
TIMER
分析得到了
OV
免
疫微环境中免疫细胞浸润的丰度
,
应用
Pearson
相关性分析探究了
TEKT2
与免疫细胞浸润的关
系。考虑到
TEKT2
的拷贝数可能影响相关性分析
的结果
,
我们用方差分析探究了不同
TEKT2
拷贝
数变异类型
OV
患者中免疫细胞浸润的差异。
细胞活力
,
具体操作
:1)
应用胰蛋白酶消化
SK-
OV3
细胞
,
然后将肿瘤细胞接种于
96
孔培养板
中
,
每孔
10
3
~10
4
个
,
在
100滋L
的培养基中培养
;
2)
取培养
0h
、
24h
、
48h
、
72h
的
SKOV3-NC
和
SKOV3-shRNA,
弃掉培养基后每孔加入
10滋L
CCK-8
试剂培养
2h,
最后在酶标仪
450nm
处测
定吸光度
(A)
。根据如下公式计算细胞存活率
(R):
R=[(A
实验孔
-A
空白孔
)/(A
对照孔
-A
空白孔
)]伊100%,
绘制
出细胞的生长活力曲线
。实验进行
3
次重复
。
1.2实验验证
1.2.1细胞培养和病毒包装
人正常卵巢上皮细胞株
IOSE80
和
OV
细胞
株
SKOV3
均购自上海冠导生物工程有限公司
,
应用含有
10%
牛血清
(16140063,
美国
Gibco
公司
)
的
DMEM
培养基
(Gibco
公司
,
美国
)
培养
,
培养条
件
:CO
2
体积分数
5%,
温度
37益
。收集对数生长
期的
SKOV3
细胞
,
于细胞培养皿中生长至
60%
后
进行转染
。针对
TEKT2
构建的短发夹
RNA(short
hairpinRNA,shRNA)
慢病毒载体由湖北新纵科病
毒疾病工程技术有限公司提供
。采用
Lipofec-
tamine
TM
3000
转染试剂
(ThermoFisherScientific
公
司
,
美国
)
将
shRNA
慢病毒载体和
LV-MAX
TM
慢病
毒生产系统
(ThermoFisherScientific
公司
,
美国
)
转
染到
293T
细胞
(
广州吉妮欧生物科技有限公司
)
中
,
72h
后收集重组慢病毒溶液
。将
10滋L
重组慢病
毒溶液加入
SKOV3
细胞中
,24h
后形成
SKOV3-
shRNA
组。培养
SKOV3
细胞
24h
作为
SKOV3-
NC
组。
1.2.2Real-timePCR
应用
Trizol
试剂盒
(
上海生工生物工程股份
有限公司
)
提取
SKOV3
细胞和
IOSE80
细胞中的
RNA
。使用
EvoM-MLV
试剂盒
(
湖南艾科瑞生物
工程有限公司
)
进行反转录。采用
SYBR誖Green
1.3统计方法
应用
Rversion4.0.2
进行数据统计分析
,Gra-
计量资料用均数
依
标准
phPadPrism8.0
用于制图。
差
(x依s)
表示
,
两组间计量资料比较采用两样本单
因素方差分析
,
以
P<0.05
为差异有统计学意义
。
2结果
2.1TEKT2在OV中的表达
GEPIA2
数据库中各肿瘤的表达结果显示
,
相比于正常对照组
,TEKT2
在
OV
、胸腺瘤
(thymo-
ma,THYM)
和子宫内膜癌
(uterinecorpusendome-
trialcarcinoma,UCEC)
等肿瘤中的表达显著增高
(P<0.05),
而在肾嫌色细胞癌
(kidneychromophobe,
肺鳞癌
(lungsquamouscellcarcinoma,LU-KICH)
、
SC)
和睾丸生殖细胞肿瘤
(testiculargermcelltumor,
进一步
TGCT)
中的表达显著降低
(P<0.05)(
图
1A)
。
对
TEKT2
在
OV
组织和癌旁组织中的差异表达
进行分析
,
结果表明
,TEKT2
在
OV
中的表达明
显较高
(P<0.05)(
图
1B)
。
2.2TEKT2与OV和其他肿瘤预后的关系
TEKT2
在
Kaplan-Meier
绘图平台的
OV
预
后相关性分析结果显示
,TEKT2
的高表达与
OV
患者的总生存期
(overallsurvival,OS)
、无复发生存
期
(recurrence-freesurvival,RFS)
较好呈正相关
(log-
rankP<0.05,
图
2A~B)
。
TIMER
数据库中
TEKT2
的预后相关性分析结果显示
,TEKT2
的高表达与
CTACTGTGCTTG-3忆
。
GAPDH-F
引物序列
:5忆-T-
CAAGAAGGTGGTGAAGCAGG-3忆,GAPDH-R
引
物序列
:5忆-TCAAAGGTGGAGGAGTGGGT-3忆
。实
验进行
3
次重复
。
PCR
反应条件
:95益45s;94益
45s,50益45s,72益90s,40
个循环
;72益
延伸
10min
。用
2
-驻驻Ct
法计算
TEKT2
的相对表达量
。
1.2.3CCK-8检测细胞活力
使用
CCK-8
试剂盒
(Gibco
公司
,
美国
)
测定
ProTaqHS
预混型
qPCR
试剂盒
(
湖南艾科瑞生
物工程有限公司
)
进行
cDNA
的扩增。
TEKT2
和
GAPDH
的引物购自广州锐博生物技术有限公司。
TEKT2-F
引物序列
:5忆-AGACCTTGGAGGAGA-
TCGCT-3忆,TEKT2-R
引物序列
:5忆-CCCGAGAC-OV
患者预后较好呈正相关
(log-rankP=0.007,
图
2C)
。
GEPIA2
数据库的生存分析结果也表明
,
TEKT2
的高表达提示
OV
患者有较好的预后
(log-
此外
,TEKT2
与多种肿瘤患
rankP=0.006,
图
2D)
。
者预后的热图显示
,TEKT2
与肾上腺皮质癌
(adre-
结肠癌
(colonadeno-nocorticalcarcinoma,ACC)
、
carcinoma,COAD)
患者的预后较差呈正相关
,
而与
肾透明细胞癌
(kidneyrenalclearcellcarcinoma,
葡萄膜黑色素瘤
(uvealmelanoma,U-KIRC)
、
OV
、
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第
2
期
袁美莉等:多数据库联合探究
TEKT2
在卵巢癌中的作用
173
VM)
患者的预后较差呈负相关
(
图
2E)
。
2.3TEKT2可作为OV患者的独立预后因素
为了考察
TEKT2
是否为
OV
的独立预后因
素
,
我们进行了单因素
Cox
回归分析和多因素
单因素
Cox
回归分析结果显示
,
年
Cox
回归分析。
2.4TEKT2与TP53的表达密切相关
为了确定
TEKT2
是否具有
OV
治疗靶点的
潜力
,
我们探究了
TEKT2
与
TP53
在包括
OV
在
内的多种肿瘤中的相关性
,
结果显示
:
在多种肿
瘤中
,TEKT2
与
TP53
呈显著的正相关
(P<0.001,
图
3A);
在
OV
中
,TEKT2
与
TP53
仍然具有显著
的正相关关系
(P<0.001,
图
3B)
。
TEKT2
与
TP53
的
相关性分布图表明
,TEKT2
与
TP53
在
OV
中的相
关性明显较高
(
图
3C)
。
TEKT2
预后价值与
TP53
突
变类型的分析结果表明
,
在
TP53
突变型
OV
患者
中
,TEKT2
与患者预后没有明确的关系
(P=0.130,
图
4A);
而在野生型
TP53OV
患者中
,TEKT2
的
高表达与患者预后较好呈正相关
(P=0.002,
图
4B)
。
*
龄
[
风险比
(hazardratio,HR)=1.025,P<0.001]
、
CD4
+
T
细胞
(HR=0.002,P=0.006)
和
TEKT2(HR=0.804,
P=0.009)
与
OV
患者的预后关系密切
(
表
1)
。多因
素
Cox
回归分析结果也表明
,
年龄
(HR=1.024,P<
中性粒细
0.001)
、
CD4
+
T
细胞
(HR=0.021,P<0.001)
、
胞
(HR=5.054,P<0.001)
、树突状细胞
(HR=0.002,
P=0.012)
和
TEKT2(HR=0.815,P=0.031)
与
OV
患
者的预后关系密切
(
表
2)
。
210
180
150
120
90
60
30
0
(A)
6
5
4
3
2
1
0
T(n=426)N(n=88)
图1TEKT2在包括OV在内的多种肿瘤中的差异表达分析
(A)TEKT2在多种肿瘤中的差异表达分析;(B)TEKT2在OV中的差异表达分析。T:肿瘤组织;N:癌旁组织;
*
:P<0.05。
Fig.1DifferentialexpressionanalysisofTEKT2invariouscancersincludingOV
(A)ThedifferentialexpressionanalysisofTEKT2inavarietyoftumors;(B)ThedifferentialexpressionanalysisofTEKT2inOV.
T:Tumortissue;N:Paracanceroustissue;
*
:P<0.05.
Table1
Age
Blackrace
Whiterace
Purity
Bcell
CD8
+
Tcell
CD4
+
Tcell
Neutrophil
Dendriticcell
TEKT2
Item
(B)
表1TEKT2与临床特征的单因素Cox回归分析结果
UnivariateCoxregressionanalysisresultsofTEKT2andclinicalcharacteristics
Coefficient
0.024
0.484
0.177
-0.381
-1.845
-0.481
-6.337
0.565
-0.986
-0.218
HR
1.025
1.622
1.193
0.683
0.158
0.618
0.002
1.759
0.373
0.804
95%CI_low
1.015
0.639
0.531
0.280
0.001
0.059
0
0.049
0.067
0.682
95%CI_up
1.035
4.119
2.682
1.665
17.515
6.524
0.167
6.585
2.076
0.947
Pvalue
<0.001
0.309
0.669
0.402
0.443
0.689
0.006
0.757
0.260
0.009
注:HR,风险比;CI,置信区间
。
Notes:HR,hazardratio;CI,confidenceinterval.
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174
Table2
Age
Blackrace
Whiterace
Purity
Bcell
CD8
+
Tcell
CD4
+
Tcell
Neutrophil
Dendriticcell
TEKT2
Item
生命科学研究
圆园23
年
表2TEKT2与临床特征的多因素Cox回归分析结果
MultivariateCoxregressionresultsofTEKT2andclinicalcharacteristics
Coefficient
0.024
0.290
-0.051
-1.512
3.713
-3.442
-16.111
1.738
-6.340
-0.218
HR
1.024
1.330
0.950
0.220
0.409
0.032
0.021
5.054
0.002
0.815
95%CI_low
1.013
0.517
0.417
0.063
0.046
0.001
0
9.377
0
0.660
95%CI_up
1.035
3.453
2.164
0.776
3.660
1.740
0
27.274
2.520
0.980
Pvalue
<0.001
0.549
0.903
0.018
0.284
0.091
<0.001
<0.001
0.012
0.031
注:HR,风险比;CI,置信区间
。
Notes:HR,hazardratio;CI,confidenceinterval.
1.0
0.8
0.6
0.4
0.2
Expression
Low
High
0
050
Numberatrisk
Low1194280
High462148
OS
HR=0.76(0.65~0.87)
log-rankP约0.001
1.0
0.8
0.6
0.4
0.2
Expression
Low
High
0
050
RFS
HR=0.78(0.66~0.93)
log-rankP=0.005
100
57
40
t/months
(A)
150
9
9
200
2
0
250
0
0
Numberatrisk
Low32355
High459138
100
t/months
(B)
12
18
150
2
0
200
1
0
1.00
0.75
0.50
0.25
0
0
log-rankP=0.007
Level
High(top50%)
1.0
0.8
0.6
0.4
0.2
Low(bottom50%)
LowTEKT2group
HighTEKT2group
log-rankP=0.006
HR(high)=0.71
P(HR)=0.0058
n(high)=211
n(low)=212
50100150
Timetofollow-up(months)
(C)
0
0
ENSG.11(TEKT2)
50100150
Timetofollow-up(months)
(D)
log
10
(HR)
0.5
0
-0.5
图2TEKT2表达与肿瘤预后的关系
(A)Kaplan-Meier绘图平台分析TEKT2对OV患者总生存期的影响;(B)Kaplan-Meier绘图平台分析TEKT2对OV患者无
复发生存期的影响;(C)TIMER数据库分析TEKT2对OV患者总生存期的影响;(D)GEPIA2数据库分析TEKT2对OV患
者总生存期的影响;(E)TEKT2在GEPIA2中与多种肿瘤预后的关系
。
Fig.2TherelationshipbetweenTEKT2expressionandtumorprognosis
(A)AnalysisoftheimpactofTEKT2onOSofOVpatientsbyKaplan-Meierplotplatform;(B)AnalysisoftheimpactofTEKT2
onRFSofOVpatientsbyKaplan-Meierplotplatform;(C)AnalysisoftheimpactofTEKT2onOSofOVpatientsusingTIMER
database;(D)AnalysisoftheimpactofTEKT2onOSofOVpatientsusingGEPIA2database;(E)TherelationshipbetweenTEKT2
andtheprognosisofmultipletumorsbasedonGEPIA2database.
(E)
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第
2
期
袁美莉等:多数据库联合探究
TEKT2
在卵巢癌中的作用
175
2.5TEKT2与肿瘤纯度、免疫细胞密切相关
本研究从
TEKT2
的表达和拷贝数变异角度
探究了其与免疫细胞浸润的相关性。
TEKT2
与肿
n=9712,r=0.14(Pearson),P约0.001
5
0
-5
-10
-10-505
ExpressionofTEKT2[log
2
(TPM)]
(A)
1.0
0.8
0.6
0.4
0.2
0
-0.2
-0.4
-0.6
-0.8
-1.0
瘤纯度及免疫细胞的相关性分析结果显示
,
其与
肿瘤纯度、巨噬细胞和中性粒细胞均具有显著相
关性
,
其中与中性粒细胞的相关性最强
(
图
5)
。
TE-
n=422,r=0.25(Pearson),P约0.001
5
0
-5
-10
-10-505
ExpressionofTEKT2[log
2
(TPM)]
(B)
OV
0.010.10
图3TEKT2与TP53的相关性
(A)TEKT2在多种肿瘤中与TP53相关性的分析;(B)TEKT2在OV中与TP53相关性的分析;(C)TEKT2在多种肿瘤中与
TP53相关性的定位。
Fig.3CorrelationbetweenTEKT2andTP53
(A)AnalysisofthecorrelationbetweenTEKT2andTP53inmultipletumors;(B)AnalysisofthecorrelationbetweenTEKT2and
TP53inOV;(C)LocalizationofthecorrelationbetweenTEKT2andTP53inmultipletumors.
1.0
0.8
0.6
0.4
0.2
Expression
Low
High
0
Low
High
Numberatrisk
13123
37595
10.00
-log
10
P
(C)
1000.00
TP53-mutated
HR=0.82(0.63~1.06)
log-rankP=0.130
1.0
0.8
0.6
0.4
0.2
Expression
Low
High
0
Numberatrisk
5025
4434
TP53-wild
HR=0.43(0.25~0.75)
log-rankP=0.002
050100150
t/months
3
11
200
0
1
250
0
0
02040
10
22
6080
t/months
4
11
100120140
1
2
0
1
0
0
图4TEKT2的预后价值与TP53突变的关系
(A)TEKT2在TP53突变型OV患者中的生存分析;(B)TEKT2在TP53野生型OV患者中的生存分析。
Fig.4TherelationshipbetweentheprognosticvalueofTEKT2andTP53mutation
(A)AnalysisofTEKT2onsurvivalofOVpatientswithmutatedTP53;(B)AnalysisofTEKT2onsurvivalofOVpatientswith
wildTP53.
(A)
0
2
Low
High
(B)
1
4
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176
生命科学研究
圆园23
年
2.6
KT2
的拷贝数变异与免疫细胞的相关性分析结果
显示
,TEKT2
的高扩增与
B
淋巴细胞的浸润相
关
,
而
TEKT2
的臂水平缺失与中性粒细胞的浸润
相关
(
图
6)
。
TEKT2的表达可影响OV细胞增殖
在上述研究中我们发现
,TEKT2
在
OV
中高
表达
,
而
TEKT2
高表达与
OV
预后较好呈正相
(
图
7B),
并采用
CCK-8
实验分析细胞的活性
,
结
果显示
,
从转染后
48h
开始
,SKOV3-shRNA
组
中细胞的增殖能力明显增高
(P<0.05,
图
7C)
。
3讨论
关。为了分析可能的机制
,
我们采用
CCK-8
实验
探究
TEKT2
对
OV
细胞增殖的调节作用。
Real-
timePCR
实验结果表明
,
与人正常卵巢上皮细胞
株
IOSE80
相比
,OV
细胞株
SKOV3
中
TEKT2
进一步应
mRNA
的表达显著增高
(P<0.05,
图
7A)
。
用慢病毒转染
SKOV3
细胞沉默
TEKT2
的表达
Purity
r=0.347
P=3.71E-15
Bcell
在过去的十几年中
,
高通量测序分析推动了
人们对
OV
分子机制的研究
,
使研究人员能够发
现
OV
的治疗靶点并将其应用于临床。
2018
年首
个
OV
靶向药物
PARP
抑制剂奥拉帕利的获批
,
全面开启了我国的
OV
靶向治疗时代。目前
,
常用
的临床
OV
靶向治疗药物主要有
:PARP
抑制剂
抗表皮生长因
奥拉帕利、
VEGF
抑制剂贝伐单抗
、
子受体
(epidermalgrowthfactorreceptor,EGFR)
的
CD8
+
Tcell
r=0.069
P=1.32E-01
CD4
+
Tcell
r=-0.06
P=1.87E-01
9
8
7
6
5
0.20.4
r=0.038
P=4.09E-01
0.60.81.00.05
9
8
7
6
5
0
Macrophage
r=-0.093
P=4.26E-02
0.100.1
Infiltrationlevel
0.20.30.120.160.20
Neutrophil
r=-0.173
P=1.41E-04
Dendriticcell
r=-0.087
P=5.56E-02
0.050.100.05
图5TEKT2与肿瘤纯度及免疫细胞浸润的相关性
Fig.5CorrelationbetweenTEKT2andtumorpurityandimmunecellinfiltration
OV
0.100.15
Infiltrationlevel
0.200.40.50.60.7
0.6
0.4
0.2
0
Bcell
**
*
Copynumber
Deepdeletion
Arm-leveldeletion
Diploid/normal
Arm-levelgain
Highamplication
CD8
+
TcellCD4
+
TcellMacrophageNeutrophilDendriticcell
图6TEKT2的基因拷贝数与免疫细胞浸润的相关性分析
与深度缺失组比较,
*
:P<0.05,
**
:P<0.01。
Fig.6CorrelationanalysisofTEKT2genecopynumberandimmunecellinfiltration
*
:P<0.05and
**
:P<0.01,comparedwithdeepdeletiongroup.
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第
2
期
袁美莉等:多数据库联合探究
TEKT2
在卵巢癌中的作用
3
2
1
0
*
177
4
3
2
1
***
4
3
2
1
0
0
SKOV3-NC
SKOV3-shRNA
*
*
IOSE80SKOV3
(A)
0
SKOV3-NCSKOV3-shRNA
(B)
24
t/h
(C)
4872
图7TEKT2对于OV细胞增殖的影响
(A)TEKT2在OV细胞株SKOV3和正常卵巢上皮细胞株IOSE80中的表达差异;(B)TEKT2在对照组(SKOV3-NC)和敲减
组(SKOV3-shRNA)的表达情况;(C)TEKT2敲减对OV细胞SKOV3增殖的影响
。
*
:P<0.05;
***
:P<0.001。
Fig.7EffectofTEKT2ontheproliferationofOVcells
(A)DifferentialexpressionofTEKT2inOVcelllineSKOV3andnormalovarianepithelialcelllineIOSE80;(B)TEKT2expres-
sioninthecontrolgroup(SKOV3-NC)andknockdowngroup(SKOV3-shRNA);(C)TheeffectofTEKT2knockdownonthepro-
liferationofSKOV3cells.
*
:P<0.05;
***
:P<0.001.
厄洛替尼
,
以及血管内皮生长因子受体
(vascular
血小板
endothelialgrowthfactorreceptor,VEGFR)
、
源性生长因子受体
(plateletderivedgrowthfactor
receptor,PDGFR)
和
c-kit(
酪氨酸激酶受体
)
等多
个受体的阻断剂帕唑帕尼
[17]
。这些靶向药物的应
用在一定程度上改善了
OV
患者的预后
,
但是进
展期
OV
患者的长期生存率仍然只有
10%~30%
[18]
。
因此
,
仅仅开发更多的靶向治疗药物并不足以攻
克癌症治疗的难题
,
对靶向治疗影响机制的探究
同样具有重要的意义。在该研究中
,
我们首次揭
示了
TEKT2
在
OV
中的作用
,TEKT2
在
OV
中高
表达
,
并可作为
OV
的独立预后因素。更重要的
是
,
我们的证据表明
TEKT2
不仅可抑制
OV
细胞
的增殖
,
而且与免疫细胞的浸润相关
。这提示
TEKT2
不仅与治疗靶点的阻断密切相关
,
而且有
可能影响免疫治疗的效果
。
目前
,
尚无研究揭示
TEKT2
在
OV
中的作
用。我们发现
,TEKT2
在
OV
中高表达
(
图
1
、图
7),
且与
OV
患者预后较好呈正相关
(
图
2)
。
Cox
回归
分析表明
,TEKT2
是
OV
的独立预后因素
(
表
1~2)
。
相关性分析显示
,TEKT2
与
TP53
的表达在包括
OV
的多种肿瘤中呈显著正相关
(
图
3),
且
TEKT2
高表达在野生型
TP53
患者中具有较好的预后价
值
(
图
4)
。
TP53
是一个关键的抑癌因子
,
可通过促
进肿瘤细胞凋亡、抑制肿瘤细胞增殖、调节免疫微
环境和抑制血管生成等过程影响包括
OV
在内的
多种肿瘤的进展
[14,19-20]
。
Leijen
等
[21]
通过大样本临
床研究发现
,TP53
突变可有效地改善卡铂的耐药
性。在该研究中
,
我们还通过
CCK-8
实验发现
TEKT2
可抑制
OV
细胞的增殖
(
图
7)
。因此
,
我们
推测
TP53
和
TEKT2
对
OV
细胞增殖的抑制具有
协同作用。
TP53
与
TEKT2
的具体互作机制有待
后续深入研究
。
此外
,
通过分析
TEKT2
与免疫细胞的相关
性
,
我们发现
TEKT2
与巨噬细胞和中性粒细胞密
切相关
(
图
5),
并且
TEKT2
的拷贝数变异与中性
粒细胞的浸润相关
(
图
6)
。巨噬细胞是人体免疫系
统的主要成员
,
在抗肿瘤免疫反应过程中发挥着
重要的作用
[22]
。传统的免疫治疗主要通过阻断免
疫检查点促进
T
细胞的抗肿瘤作用
,
近年来
,
越
来越多的研究者将目光投向了固有免疫细胞。例
如
,CD47
可通过抑制巨噬细胞促进
OV
的转移
,
而二氟甲基鸟氨酸
(difluoromethylornithine,DFMO)
和
5-
氮胞苷可通过促进
M1
巨噬细胞的浸润抑
制
OV
的发展
[23-24]
。我们发现
TEKT2
与中性粒细
胞和巨噬细胞相关
,
这说明
TEKT2
在固有免疫细
胞抗肿瘤的过程中发挥着重要的作用。然而
,
目
前关于
TEKT2
与免疫细胞浸润的关系尚不明确
,
因此进一步探究
TEKT2
的免疫调节作用很有可
能为
OV
的免疫治疗提供新的思路
。我们发现的
TEKT2
与固有免疫细胞的关系为
OV
治疗的研究
打开了新的大门
,
后续应用大样本基础研究对其
进行深入探讨很有必要。
总而言之
,
该研究首次揭示了
TEKT2
在
OV
中的保护机制。
TEKT2
不仅可抑制
OV
细胞的增
殖
,
而且与
TP53
具有协同抗癌作用。更重要的
是
,TEKT2
可能通过调节中性粒细胞和巨噬细胞
在固有免疫细胞抗
OV
过程中发挥作用。因此
,
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178
生命科学研究
圆园23
年
TEKT2
可从多个方面对
OV
发挥抑制作用。
参考文献(References):
[1]SLATNIKCLP,ncancer:ensuringearlydiag-
nosis[J].TheNursePractitioner,2015,40(9):47-54.
[2]CHIENJ,ncancerprevention,screening,
andearlydetection:reportfromthe11thbiennialovariancan-
cerresearchsymposium[J].InternationalJournalofGynecologi-
calCancer,2017,27(9SSuppl.5):S20-S22.
[3]entofovariancanceratthecrossroads:50
yearsaftersingle-agentmelphalanchemotherapy[J].Oncology,
2006,20(10):1156,1158.
[4]LHEUREUXS,BRAUNSTEINM,lialovarian
cancer:evolutionofmanagementintheeraofprecisionmedi-
cine[J].CA:ACancerJournalforClinicians,2019,69(4):280-
304.
[5]MIRZAMR,COLEMANRL,GONZ魣LEZ-MART魱NA,etal.
Theforefrontofovariancancertherapy:updateonPARPin-
hibitors[J].AnnalsofOncology,2020,31(9):1148-1159.
[6]CHENY,ZHANGL,LIUWX,dSEMA4D
havesynergisticeffectsonthepromotionofangiogenesisin
epithelialovariancancer[J].Cellular&MolecularBiologyLet-
ters,2018,23:2.
[7]MABUCHIS,KURODAH,TAKAHASHIR,3K/
AKT/mTORpathwayasatherapeutictargetinovariancancer[J].
GynecologicOncology,2015,137(1):173-179.
[8]WOLKOWICZMJ,NAABY-HANSENS,GAMBLEAR,etal.
TektinB1demonstratesflagellarlocalizationinhumansperm[J].
BiologyofReproduction,2002,66(1):241-250.
[9]SHIMASAKIS,YAMAMOTOE,MURAYAMAE,-
cellularlocalizationofTektin2inratspermflagellum[J].Zoo-
logicalScience,2010,27(9):755-761.
[10]YOONH,LEEDJ,KIMMH,ficationofgenes
concordantlyexpressedwithAtoh1duringinnereardevelop-
ment[J].Anatomy&CellBiology,2011,44(1):69-78.
[11]TANGZF,KANGBX,LICW,2:anenhanced
webserverforlarge-scaleexpressionprofilingandinteractive
analysis[J].NucleicAcidsResearch,2019,47(W1):W556-W560.
[12]HOUGX,LIUPP,YANGJ,expressionand
prognosisoftopoisomeraseisoformsinnon-small-celllung
cancerbyusingOncomineandKaplan-Meierplotter[J].PLoS
[13]
[14]
[15]
[16]
[17]
[18]
[19]
[20]
[21]
[22]
[23]
[24]
One,2017,12(3):e0174515.
LITW,FANJY,WANGBB,:awebserverfor
comprehensiveanalysisoftumor-infiltratingimmunecells[J].
CancerResearch,2017,77(21):e108-e110.
SILWAL-PANDITL,LANGER覫DA,B覫RRESEN-DALEA
53mutationsinbreastandovariancancer[J].ColdSpring
HarborPerspectivesinMedicine,2017,7(1):a026252.
BACID,BOSIA,GALLAZZIM,riancancertu-
morimmunemicroenvironment(TIME)astargetfortherapy:a
focusoninnateimmunitycellsastherapeuticeffectors[J].In-
ternationalJournalofMolecularSciences,2020,21(9):3125.
ANDERSONKG,STROMNESIM,-
staclesposedbythetumormicroenvironmenttoTcellactivity:
acaseforsynergistictherapies[J].CancerCell,2017,31(3):
311-325.
NAKAMURAK,SAWADAK,KOBAYASHIM,
theexosomeinovariancancerprogressionanditspotentialas
atherapeutictarget[J].Cancers,2019,11(8):1147.
YANGYF,YANGY,YANGJ,icroenviron-
mentinovariancancer:functionandtherapeuticstrategy[J].
FrontiersinCellandDevelopmentalBiology,2020,8:758.
BIEGINGKT,MELLOSS,llingmecha-
nismsofp53-mediatedtumoursuppression[J].NatureReviews
Cancer,2014,14(5):359-370.
LANED,LEVINEA.p53research:thepastthirtyyearsand
thenextthirtyyears[J].ColdSpringHarborPerspectivesinBio-
logy,2010,2(12):a000893.
LEIJENS,VANGEELRMJM,SONKEGS,域
studyofWEE1inhibitorAZD1775pluscarboplatininpatients
withTP53-mutatedovariancancerrefractoryorresistantto
first-linetherapywithin3months[J].JournalofClinicalOnco-
logy,2016,34(36):4354-4361.
MANTOVANIA,SOZZANIS,LOCATIM,hage
polarization:tumor-associatedmacrophagesasaparadigmfor
polarizedM2mononuclearphagocytes[J].TrendsinImmunology,
2002,23(11):549-555.
LIUR,WEIHT,GAOP,47promotesovariancan-
cerprogressionbyinhibitingmacrophagephagocytosis[J].On-
cotarget,2017,8(24):39021-39032.
TRAVERSM,BROWNSM,DUNWORTHM,
and5-azacytidineincreaseM1macrophagesinthetumormi-
croenvironmentofmurineovariancancer[J].CancerResearch,
2019,79(13):3445-3454.
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