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2024年3月20日发(作者:匿名聊天官网)
·
894
·
DOI10.13602/j.cnki.jcls.2020.12.04
临床检验杂志
2020
年
12
月第
38
卷第
12
期
ChinJClinLabSciDec.2020Vol.38No.12
,,,
:
胞的侵袭
LncRNADCST1AS1
结合
ALDOA
促进三阴性乳腺癌细
·临床实验研究·
王琴
,
唐莉
(
江苏省肿瘤医院
&
江苏省肿瘤防治研究所
&
南京医科大学附属肿瘤医院检验科
,
南京
210009
)
LncRNA
)
DCST1AS1
结合果糖二磷酸醛缩酶
A
(
fructosebisphosphatealdolaseA
,
ALDOA
)
摘要
:
目的
探索长链非编码
RNA
(
MDAMB231
)
对三阴性乳腺癌细胞
(
侵袭的影响
。
方法
采用
RNApulldown
试验
、
质谱分析和
RNA
免疫共沉淀试验检测并
TheCancerGenomeAtlas
,
TCGA
)
采用癌症基因组图集
(
中的侵袭性乳腺癌阵列分析
DCST1AS1
与
ALDOA
之间的相互作用
;
RTPCR
和
westernblot
分析三阴性乳腺癌细胞中
DCST1AS1
失调对
ALDOA
表达
分析
DCST1AS1
与
ALDOA
表达的相关性
;
Transwell
试验分析
DCST1AS1
结合
ALDOA
对乳腺癌侵袭能力的影响
。
结果
DCST1AS1
在乳腺癌细胞内与
ALDOA
的影响
;
P<0.01
)
r
=
0.19
,
P<0.01
),。
与阴性对直接结合
。
ALDOA
在
TCGA
乳腺癌阵列中高表达
(
并与
DCST1AS1
的表达呈正相关
(
照组相比
,
干扰
ALDOA
能抑制
DCST1AS1
对
MDAMB231
细胞的促侵袭功能
。
结论
DCST1AS1
通过与
ALDOA
直接结合
促进三阴性乳腺癌细胞的侵袭
。
关键词
:
乳腺癌
;
侵袭
;
长链非编码
RNA
;
果糖二磷酸醛缩酶
A
R446
;
R73.37
文献标志码
:
A
中图分类号
:
LncRNADCST1AS1combinedwithALDOApromotestriplenegativebreastcancercellinvasion
WANGQinTANGLiDepartmentofClinicalLaboratoryJiangsuCancerHospital&JiangsuInstituteofCancerResearch&theAffilia
tedCancerHospitalofNanjingMedicalUniversityNanjing210009JiangsuChina
AbstractObjective ThepurposeofthisstudyistoexploretheeffectsoflongnoncodingRNADCST1AS1
,(
containing1antisense1
)
combinedwithfructosediphosphatealdolaseA
(
ALDOA
)
ontheinvasionoftriplenegativebreastcancer
MDAMB231
)
.Methods RNApulldownexperiment
,
massspectrometryandRNAimmunoprecipitationexperimentwereusedcells
(
tostudytheinteractionbetweenDCST1AS1andALDOA.TheCancerGenomeAtlasarrayinTheCancerGenomeAtlas
(
TCGA
)
was
ofdysregulationofDCST1AS1onALDOAexpression.TranswellexperimentwasusedtoexploretheeffectsofDCST1AS1combined
withALDOAonbreastcancercellinvasion.Results DCST1AS1directlybindstoALDOAinbreastcancercells.ALDOAwashighly
expressedinTCGAbreastcancerarrayP<0.01
:
,
,
,,)
(
DCSTAMPdomain
usedtoanalyzethecorrelationbetweenDCST1AS1andALDOAexpression.RTPCRandWesternblotwereusedtoanalyzetheeffects
paredwiththenegativecontrolgrouptheinterferencewithALDOAinhibitedtheproinvasivefunctionofDCST1AS1onMDAMB231
cells.Conclusion DCST1AS1maydirectlybindtoALDOAtopromotetheinvasionoftriplenegativebreastcancercells.
KeywordsbreastcancerinvasionlongnoncodingRNAfructosediphosphatealdolaseA
,
(
P<0.01
)
.Com
),
andpositivelycorrelatedwithDCST1AS1expression
(
r
=
0.19
,
三阴性乳腺癌(
triplenegativebreastcancer
,
TN
BC
)
estrogenreceptor
,
ER
)是雌激素受体(、孕激素受
体(和人表皮生长因子受
progesteronereceptor
,
PR
)
体
2
(
humanepidermalgrowthfactorreceptor2
,
均为阴性的异质性疾病,具有侵袭程度高、
HER2
)
易远处转移等特点,是乳腺癌中预后较差的亚型,而
寻找有效的分子诊断指标和治疗靶标是解决这一困
境的有效途径。
DCSTAMP
域包含
1
反义链
1
(
DCSTAMP
domaincontaining1antisense1
,
DCST1AS1
)是本课
longnoncodingRNA
,题组采用长链非编码
RNA
(
:;;;
)芯片在
TNBC
组织中筛选获得的上调表达
的
LncRNA
并证实
DCST1AS1
可作为
TNBC
有效的
分子诊断指标,且能够通过与
miR8735p
和致癌基
因
MYC
形成正调控环以促进
TNBC
细胞的增殖和
转移
[]
。此外,笔者还发现
DCST1AS1
可以通过与
膜联蛋白
A1
(
ANXA1
)结合通过促进上皮
-
间质转
EMT
)化(以增强
TNBC
细胞的化学耐药性
[]
。本
研究拟进一步分析
DCST1AS1
通过结合果糖二磷
酸醛缩酶
A
(
fructosebisphosphatealdolaseA
,
AL
DOA
)促进
TNBC
细胞侵袭的机制。
LncRNA
1
2
国家自然科学基金(;江苏省自然科学基金(。
81802898
)
BK20181090
)
基金项目
:
作者简介
:王琴,女,主管技师,大学本科,从事肿瘤标志物的相关研究。
1975
年生,
通信作者
:唐莉,副主任技师,
Email
:
tangli@nju.edu.cn
。
临床检验杂志
2020
年
12
月第
38
卷第
12
期
1
材料和方法
1.1
ChinJClinLabSciDec.2020Vol.38No.12
,
细胞系、主要试剂及仪器
三阴性乳腺癌细胞
系
MDAMB231
和
BT549
(中国科学院上海细胞
库),上海康成公司),
LncRNA
芯片(
L15
培养基、
胰蛋白酶
-
EDTA
(和胎
RPMI1640
培养基、
0.25%
)
均购自美国
Gibco
牛血清(
fetalbovineserum
,
FBS
)
PrimeScriptRT
试剂盒和
TBGreenPremixEx
公司,
日本
TaKaRa
公司),
MagnaRIPTaq
Ⅱ
试剂盒(
美国
MerckMilliRNA
结合蛋白免疫沉淀试剂盒(
TM
·
895
·
2
×
)
10
μ
L
,
Taq
Ⅱ
(上、下游引物(
10
μ
mol/L
)各
0.8
μ
L
,
DNA
模板
2
μ
L
,灭菌水
6.4
μ
L
。使用两步
法进行
PCR
扩增,循环参数:
95℃30s
;
95℃5s
,
共
40
个循环。在
56℃
时收集每个循环
56℃20s
,
的荧光信号,进行熔解曲线分析。采用仪器自带软
件分析扩增曲线和熔解曲线中的荧光信号,并计算
Ct
值)平均阈值循环数(。通过
2
法计算待测基
因的相对表达量,公式:
Δ
Ct
实验组
=
Ct
实验组待测基因
-
,
Δ
Ct
对照组
=
Ct
对照组待测基因
-
Ct
对照组
;
Ct
实验组
。
,,
-
ΔΔ
Ct
GAPDHGAPDH
pore
隆兔抗体
公司),
RIPA
裂解液(上海碧云天公司),多克
(
antiALDOA
(
ab245469
)和羊抗兔
antiIgG
ab205718
(
(
)购自美国
Abcam
公司,
ALDOA
小干扰
RNAsmallinterferingRNA
,
siRNA
)和阴性对照
玛公司)
smallinterfering
,转染试剂
negativecontrol
,
siNC
)购自上海吉
LipofectamineRNAiMAX
(美国
Invitrogen
公司)
司),
,
公司)。
LightCyclerPCR
仪(美国
Roche
TransBlotSD
半干转膜仪(美国
BioRad
公
Corning
BioCoat
TM
ning
公司)
公司)
国
,
,
肿瘤浸润
24
孔板(美国
Cor
OneDrop
超微量分光光度仪(南京五义
TripleTOFTM5600plus
液质联用质谱仪(美
AB
的
细胞培养
Sciex
公司)。
1.2 MDAMB231
细胞使用含
10%FBS
L15
培养基,置于
37℃
、空气培养箱中培养。
BT549
置于
细胞使用含
10%FBS
的
RPMI1640
培养基,
37℃
、
5%CO
2
培养箱中培养。
1
取细胞总
.3 RNA
提取及
RTPCR
反应
用
Trizol
试剂提
10
6
度(
个,使用
RNA
,单次提取
RNA
的细胞总数不少于
用于后续检测。按照
A
260/280nm
)
OneDrop
值,取
超微量分光光度仪检测吸光
A
260/280nm
值在
1.9~2.1
间的样本
将总量为
PrimeScriptRT
试剂盒说明书
1
μ
gRNA
逆转录为
cDNA
,
由上海生工公司合成。
保存。使用软件设计引物,
样本置于
-
20℃PrimerPremier6.0
引物序列:
DCST1AS1
(
NR_040773.1
)上游
物序列:
5′CCACTCACCAGCTTCTTC3′
;下游引
为
5′CTTCTGCTATGTCTCACAC3′
,退火温度
56℃
,扩增片段长度为
236bp
。
ALDOA
(
;
)
NM_
001127617.2
上游引物序列:
5′TGTCAGGGGCTTCA
GGTTTC3′
下游引物序列:
GCGGC3′
退火温度为
5′TAGTAGCAAGTTCCT
56℃
,扩增片段长度为
203
达
[
3
]
bp
。使用
,以
,
GAPDH
作为内参计算相对
mRNA
表
LightCyclerPCR
仪及
TBGreen
Premix
ExTaq
TM
Ⅱ
试剂盒进行实时荧光定量
PCR
检测。
PCR
总反应体积为
20
μ
L
,包括:
TBGreenPremixEx
ΔΔ
Ct
=
Δ
Ct
实验组
-
Δ
Ct
对照组
1
得
.4 RNApulldown
连接酶将单个脱硫生物素化胞苷二磷酸酯连接至
的正义链和反义链,
和质谱测定
通过体外转录获
DCST1AS1
并使用
T4RNA
RNA
正义链和反义链分别与
链的
3′
末端。将
1
μ
g
生物素化的
DCST1AS1
记的磁珠混合,
50
μ
L
重悬的链霉亲和素标
的裂解液中室温温育
4℃
温育过夜,再加入
BT549
细胞
用
1h
,同时加入
液质联用质谱仪分析与
RNase
抑制剂。
TripleTOFTM5600plus
RNA
果:
据,
在可信度
结合的蛋白质。通过
≥
95%
至少包含
Proteinpilot
软件分析结
1
个肽段时读取数
污染蛋白质。用于转录的
同时剔除角蛋白、
,
抗体蛋白、血清清蛋白等常见
列:
DCST1AS1
上游引物序
5′TAATACGACTCACTATAGGGAAAGCCCGGGA
GCGCGCAGACTTGGCTGTGCG3′
;下游引物序列:
5′TTTTTTCACACTTTACAGAGTTTGTTTAATGT3′
用于扩增反义
。
DCST1AS1
的上游引物序列:
5′TAA
TACGACTCACTATAGGGTTTTTTCACACTTTACAGA
GTTTGTTTAATGT3′
;下游引物序列:
5′AAAGCCCG
GGAGCGCGCAGACTTGGCTGTGCG3′
。
1.5 RNA
免疫沉淀试验测定
按照
MagnaRIP
RNA
结合蛋白免疫沉淀试剂盒说明书操作进行
RNA
以测定
免疫沉淀(
RNAimmunoprecipitation
,
RIP
),用
TNBC
细胞中能与
ALDOA
蛋白结合的
DCST1AS1
为每反应管
。用于免疫沉淀的
ALDOA
抗体加入量
实时荧光定量
5
μ
g
,以
IgG
作为阴性对照。按照上述
淀中的
PCR
和
步骤扩增
antiALDOA
和
IgG
沉
DCST1AS1GAPDH
,并以
IgG
DCST1AS1
作为阴性对照。通过
2
-
ΔΔ
Ct
法计算
沉淀组中的
anti
ALDOA
沉淀组中
DCST1AS1
的相对表达量。
1.6 westernblot
使用本课题组前期工作
[
1
备的用慢病毒作为载体的稳定干扰
]
中制
DCST1AS1
的
BT549sh
达
细胞及其阴性对照
BT549NC
,稳定过表
DCST1AS1
。将细胞分别接种于
的
MDA231exp
细胞及其阴性对照
MDA231NC6
孔细胞培养板
·
896
·
临床检验杂志
2020
年
12
月第
38
卷第
12
期
ChinJClinLabSci
,
Dec.2020
,
Vol.38
,
No.12
中,当细胞融合度达
90%
、单孔细胞总数不少于
10
性。以
P<0.05
为差异有统计学意义。
个时,收集细胞,用预冷的
PBS
洗涤并用
RIPA
缓冲
2
结果
液裂解。使用标准
Bradford
试剂盒测定细胞裂解液
中的蛋白质水平,用
10%SDSPAGE
电泳分离总蛋
2.1 DCST1AS1
的靶蛋白分析
通过
RNApull
共计有
25
种蛋白质能特异性与
DCST1
白质,使用
TransBlotSD
半干转膜仪调节稳定电流
down
测定,
转膜
120min
,将蛋白质转移至聚偏二氟
AS1
正义链结合。将这
25
种蛋白质与本课题组前
为
200mA
,
乙烯膜,用
TBST
充分洗涤。随后用含
5%BSA
的
期检测的三阴性乳腺癌组织
LncRNA
芯片数据中显
室温摇床振荡温育
2h
。再次用
TBST
著上调表达的
2092
种基因
[]
进行整合(
GeneEx
TBST
封闭,
,结果发现磷酸三糖
充分洗涤后,加入多克隆兔抗体
antiALDOA
(
1∶
pressionOmnibusGSE115275
)
、
AL
与膜在
4℃
摇床温育过夜。加入辣根过
异构酶
1
(
triosephosphateIsomerase1
,
TPI1
)
1000
稀释)
同时存在于
corneodesmosin
,
CDSN
)
DOA
和角蛋白(
氧化物酶偶联的山羊抗兔抗体
antiIgG
(
1∶2000
稀
。
TPI1
、
ALDOA
、
CDSN
蛋白分
释)与膜在室温摇床振荡反应
2h
。用
GAPDH
作为
这
2
项检测中(图
1
)
蛋白质表达的内参照。使用
SYNGENEG
:
BOX
子中与
DCST1AS1
结合的序列分别为
SNVS
ALANSLACQGK
和
SNVSDAVAQSTR
。
英国
Syngene
公司)采集图像,并使
DAVAQSTR
、
chemiXR5
系统(
用
GelPro32
软件读取并计算
ALDOA
和
GAPDH
的
蛋白质灰度值。
1.7
细胞侵袭能力测定
预包被基质胶的
Corni
该小室由
ngBioCoat
肿瘤浸润
24
孔细胞培养板[
Transwell
膜滤器(孔径为
8
μ
m
)插入
24
孔细胞培养
板中组成],用不含血清的培养基将待测细胞密度
图
1
韦恩图分析乳腺癌组织芯片检测结果和
pulldown
调节至
2.5
×
10mL
,取
200
μ
L
细胞悬液加入小室上
蛋白的质谱检测结果
室中,并将
500
μ
L
含
10%FBS
的培养基加入小室下
2.2 DCST1AS1
与
ALDOA
表达的相关性分析
通
室中,置于
37℃
细胞培养箱中温育
10h
。使用棉签
过
GEPIA2
分析癌症基因组图集(
TheCancer
擦去小室膜上层的基质胶和未穿过膜的细胞。用
GenomeAtlas
,中的乳腺癌阵列结果发现,
TCGA
)
通过
ALDOA
在乳腺癌中显著上调表达,
4%
多聚甲醛固定膜下层细胞后用结晶紫染色,
TPI1
、
CDSN
在乳
倒置显微镜观察比较穿过基质胶与膜小孔的细胞。
腺癌组织和正常组织中的表达差异无统计学意义
1.8
统计学分析
采用
GraphPadPrism7
统计软件
图
2
)。
Pearson
相关性分析发现,
DCST1AS1
与
处理数据,所有实验数据至少重复
3
次。配对
t
检
(
P<0.01
)表达量呈正相关(
r
=
0.19
,,而与
验用于
RTPCR
中实验组与对照组差异的比较。单
ALDOA
(、
r
=
0.013
,
P
=
0.65
)
CDSN
(
r
=
0.045
,
P
=
0.12
)
尾
ANOVA
用于
TCGA
乳腺癌阵列中肿瘤组织与正
TPI1
常组织的基因表达差异的比较。
Pearson
相关性系
的表达量均无相关性。
数用于分析
DCST1AS1
与靶蛋白表达之间的相关
6
1
TM
5
注:肿瘤组织(红色);正常组织(灰色);每百万映射读取的转录本;
T
,
N
,
TPM
,
P<0.01
。
,
TPI1
和
CDSN
在癌组织和正常组织中的表达
图
2
箱形图分析
ALDOA
、
2.3 DCST1AS1
与
ALDOA
结合并影响其表达
RTPCR
检测发现,与阴性对照组(
100%
)相比,
·
897
·
ALDOAmRNA
的相对表达量在
DCST1AS1
缺失时
ALDOA0.09
)(图
3A
)。
westernblot
检测结果表明,
P<0.05
)下调至
58.8%
(
t
=
15.6
,,而在
DCST1AS1
在蛋白质水平的变化趋势与
mRNA
水平相同(图
t
=
35.6
,
P<0.05
)
TPImR3B
)过表达时上调至
368.8%
(;。进一步用剩余的拉下蛋白液进行
westernblot
鉴定,发现只有
DCST1AS1
正义链拉下的蛋白液中
NA
在
DCST1AS1
缺失时下调至
98.0%
(
t
=
1.10
,
P
=
0.33
),而在
DCST1AS1
过表达时上调至
119.1%
检测到
ALDOA
(图
3C
)。
RIP
结合
RTPCR
实验表
(;明,在
ALDOA
蛋白的
RNA
沉淀物中检出的
t
=
2.46
,
P
=
0.07
)
CDSNmRNA
在
DCST1AS1
缺
失时上调至
112.2%
(
t
=
2.21
,
P
=
0.10
),而在
DCST1AS1
表达量是阴性对照组的
455.7
倍(
t
=
。
DCST1AS1
过表达时上调至
132.1%
(
t
=
2.23
,
P
=
P<0.05
)
51.5
,
临床检验杂志
2020
年
12
月第
38
卷第
12
期
ChinJClinLabSciDec.2020Vol.38No.12
,,,
A
,
RTPCR
检测
DCST1AS1
缺失和过表达时
TPI1
、
ALDOA
和
CDSNmRNA
的变化,
P<0.05
;
B
,
westernblot
检测
DCST1AS1
敲减和注:
,
C
,
westernblot
检测
DCST1AS1
的正义链和反义链拉下蛋白液中的
ALDOA
。过表达时
ALDOA
蛋白质水平的变化;
图
3 DCST1AS1
与
ALDOA
结合并影响其表达
2.4 DCST1AS1
结合
ALDOA
促进乳腺癌细胞的侵
DCST1AS1
表达并未受到明显影响(
t
=
1.91
,
P
=
袭
RTPCR
结果表明,图
4A
)。
Transwell
侵袭试验表明,干扰
ALDOAsiRNA
能有效干扰
0.13
)(
将
ALDOAALDOA
的表达抑制了
MDA231exp
细胞的侵袭
MDAMB231
细胞中的
ALDOAmRNA
,
,而(图
4B
)。
mRNA
下调至对照组的
10.8%
(
t
=
29.8
,
P<0.05
)
×
200
)
A
,
RTPCR
检测
ALDOAsiRNA
的干扰效率,
P<0.05
;
B
,
Transwell
侵袭试验检测
ALDOA
对
DCST1AS1
侵袭能力的影响(注:。
,
图
4 DCST1AS1
结合
ALDOA
促进乳腺癌的侵袭
12
3
讨论
性
[]
。除了乳腺癌,
DCST1AS1
作为促癌因子发
挥作用也在其他类型的癌症中得到了证实。有学者
LncRNA
的失调是在各种癌症中观察到的特征
指出,
DCST1AS1
在子宫内膜癌中表达上调并通过
DCST1AS1
标志之一
[]
。本课题组前期研究发现,
影响
Notch1
蛋白促进癌症侵袭和转移
[]
。
DCST1
在
TNBC
中上调表达且与癌组织的远端转移(
P
=
AS1
参与调节
AKT/mTOR
信号通路,促进肝癌细胞
及病理组织学(
P
=
0.026
)分级相关;
0.024
)
DCST1
[]
。
DCST1AS1
可以通过竞争的增殖、转移和自噬
AS1
能够促进乳腺癌细胞的增殖、转移和化疗耐药
4
5
6
·
898
·
临床检验杂志
2020
年
12
月第
38
卷第
12
期
ChinJClinLabSci
,
Dec.2020
,
Vol.38
,
No.12
内源性
miR6053p
调节胃癌细胞的增殖、迁移、侵
],,():
袭和凋亡
[]
。在本研究中,笔者提出
DCST1AS1
能
[]
[
,,,
够与
ALDOA
直接结合,通过调控
ALDOA
的表达以
促进三阴性乳腺癌细胞的侵袭。
[]
ALDOA
是关键的糖酵解酶,在包括乳腺癌在内
,,:
在食管鳞状细胞
的多种类型的癌症中呈高表达,被认为是独立的癌
[]王晓飞,崔渊博,孙晓燕,等血浆
]临床检验杂志,,():
症临床预后标志物
[]
。
ALDOA
在促进癌症转移方
[]
癌中的表达及意义[
,,,
面的功能得到了广泛的研究;有学者证实
ALDOA
:[],
能够促进上皮间质转化(
EMT
),从而促进宫颈癌恶
,:
[]
性进程;
ALDOA
的过表达增加了肺癌细胞系在体
[],,,
cancerbyformingapositiveregulatoryloopwithmiR8735pand
MYCJ.JCancer2020112311323.
7
2TangLChenYChenHetal.DCST1AS1promotesTGF
β
in
ducedepithelial
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