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2024年12月29日发(作者:登录界面怎设计的好看)

TaKaRa Code:D2680A

®

PrimeScript

Reverse

Transcriptase

说明书

宝生物工程(大连)有限公司

目 录

内 容

●制品说明

●包 装

●保 存

●酶贮存溶液

●起 源

●活性定义

●纯 度

●用 途

●添附Buffer组成

●1st-Strand cDNA合成的实验操作方法

页 码

1

1

1

1

1

1

1

1

1

2

2

●使用Mouse Heart Total RNA进行RT-PCR反应的实验例

●使用HL60 Total RNA进行Human TFR基因(4.4 kbp)的

RT-PCR反应的实验例

●使用本制品进行2 Step Real Time RT-PCR反应的实验例

4

5

●制品说明

PrimeScript Reverse Transcriptase是TaKaRa公司独自开发的一种新型RNase H

-

型反转录酶。本酶具

有极强的延伸能力,能够有效地合成1st-strand cDNA,即使对有复杂二级结构的RNA,在42℃条件下

也能得到良好的反应效果,无需进行高温反转录反应,高温的反转录反应会导致RNA的降解。本酶适合于

长链cDNA的合成及高比例的全长cDNA文库的构建等。本酶具有以下特性:

z 超强的延伸能力

本反转录酶可以对10kb以上的RNA模板进行良好的反转录反应。

z 良好的反转录效率

本反转录酶可以对极少量的RNA模板进行良好的反转录反应。

z 复杂结构RNA的反转录性能

本反转录酶在标准的反转录温度条件下(42℃)对高GC含量的RNA模板能够进行良好的反转录反

应。

●包 装:

PrimeScript Reverse Transcriptase(200 U/μl)

5×PrimeScript Buffer

●保 存:

-20℃。

10,000 Units

500 μl

●酶贮存溶液

Tris-HCl(pH7.8)

NaCl

EDTA

DTT

Glycerol(V/V)

20mM

100mM

1.0mM

1.0mM

50%

●起 源:

Purified from an

strain expressing a recombinant enzyme

●活性定义

以Poly(rA)

·

Oligo(dT)为模板/引物,在37℃、10分钟条件下,掺入1 nmol的 [

3

H] dTTP所需要

的酶量定义为1个活性单位(U)。

●纯 度:

1) 200 U的本酶和1 μg的λDNA-

Hin

d III在37℃下反应1小时,DNA的电泳谱带不发生变化。

2) 200 U的本酶和1 μg的Supercoiled pBR322 DNA在37℃下反应1小时,DNA的电泳谱带不发

生变化。

3) 200 U的本酶和1 μg的16S,23S rRNA在37℃下反应1小时,RNA的电泳谱带不发生变化。

●用 途:

1) lst-Strand cDNA的合成。

2) cDNA Probe的制备。

3) 普通RT-PCR反应以及Real Time RT-PCR反应。

●添附Buffer组成(保存:-20℃)

5×PrimeScript Buffer(cDNA合成用)

Tris-HCl(pH8.3)

KCl

MgCl

2

-1-

250 mM

375 mM

15 mM

●1st-Strand cDNA合成的实验操作方法

1. 在Microtube管中配制下列混合液。

试剂名称

模板RNA

Oligo dT Primer(50 μM)

或Random Primers(50 μM)

或Specific Primer(2 μM)

dNTP Mixture (10 mM each)

RNase free dH

2

O

1 μl

up to 10 μl

1 μl

使 用 量

1 μg*

* Total RNA的使用量一般为5 μg以下;mRNA的使用量一般为1 μg以下。

2. 65℃保温5分钟后迅速在冰上急冷2分钟以上。

3. 离心数秒钟使模板RNA/引物等的混合液聚集于Microtube管底部。

4. 在上述Microtube管中配制下列反转录反应液。

试剂名称

上述模板RNA/引物等的混合液

5×PrimeScript Buffer

RNase Inhibitor(40 U/μl)

PrimeScript Reverse Transcriptase(200 U/μl)

RNase free dH

2

O

5. 30℃ 10 min*

42℃(~50℃) ** 30~60 min

* 以Random Primers作为反转录引物时应先进行30℃,10分钟反应。

** PrimeScript Reverse Transcriptase延伸能力强,通常情况下,即使模板RNA具有复杂的二级

结构,也可以在42℃下进行反转录反应。但当反转录引物使用PCR的下游引物时,由于引物错配

的原因等易发生非特异性反应,这时可以将反转录温度设为50℃。

6. 70℃保温15分钟后冰上冷却,得到的cDNA溶液可直接用于2nd-Strand cDNA的合成或者PCR

扩增等,PCR扩增时,cDNA溶液的使用量建议使用1~5 μl。

使 用 量

10 μl

4 μl

0. 5 μl

100~200 units

up to 20 μl

●使用Mouse Heart Total RNA进行RT-PCR反应的实验例

使用Mouse Heart Total RNA,分别进行RT-PCR反应,扩增了2 kbp、6 kbp、8 kbp和12 kbp的

目的DNA片段。

1.反转录反应

在Microtube管中配制下列混合液。

试剂名称

Mouse Heart Total RNA

Oligo dT

Primer(50 μM)

dNTP Mixture(10 mM each)

RNase free dH

2

O

② 65℃保温5分钟后迅速在冰上急冷2分钟以上。

③ 离心数秒钟使模板RNA/引物等的混合液聚集于Microtube管底部。

-2-

使 用 量

1 μl*

1 μl

1 μl

up to 10 μl

* Mouse Heart Total RNA使用量分别为1 μg、100 ng、10 ng。

④ 在上述Microtube管中配制下列反转录反应液。

试剂名称

上述模板RNA/引物等的混合液

5×PrimeScript Buffer

RNase Inhibitor(40 U/μl)

PrimeScript Reverse Transcriptase(200 U/μl)

RNase free dH

2

O

⑤ 42℃保温30分钟。

使 用 量

10 μl

4 μl

0.5 μl

0.5 μl

up to 20 μl

⑥ 70℃保温15分钟后冰上冷却,得到的cDNA溶液用于PCR扩增。

2.PCR反应

① 按下列组成配制PCR反应液,全量50 μl。

试剂名称

上述cDNA溶液

dNTP Mixture(2.5 mM each)

Forward Primer(10 μM)

Reverse Primer(10 μM)

10×LA PCR Buffer II(Mg

2+

Plus)

使 用 量

2 μl

8 μl

1 μl

1 μl

5 μl

0.5 μl

up to 50 μl

TaKaRa LA Taq

(5 U/μl)

dH

2

O

② PCR反应条件如下:

2 kbp、6 kbp、8 kbp、12 kbp的PCR反应条件

94℃ 1 min

98℃ 20 sec

68℃ 2/6/8/12 min

30 Cycles

72℃ 10 min

3.RT-PCR扩增结果

PCR反应结束后,取5 μl的PCR反应液进行了琼脂糖凝胶电泳,结果如下。

2kbp

6kbp 8kbp 12kbp

M3M

M: λ-

Hin

d III digest DNA Marker

1 : Total RNA 1 μg的RT-PCR扩增结

2 : Total RNA 100 ng的RT-PCR

扩增结果

3 : Total RNA 10 ng的RT-PCR扩增

结果

-3-

● 使用HL60 Total RNA进行Human TFR基因(4.4 kbp)的RT-PCR反应的实验例

1.反转录反应

① 在Microtube管中配制下列混合液。

试剂名称

HL60 Total RNA(100 ng/μl)

Oligo dT Primer(50 μM)

dNTP Mixture(10 mM each)

RNase free dH

2

O

② 65℃保温5分钟后迅速在冰上急冷2分钟以上。

③ 离心数秒钟使模板RNA/引物等的混合液聚集于Microtube管底部。

④ 在上述Microtube管中配制下列反转录反应液。

试剂名称

上述模板RNA/引物等的混合液

5×PrimeScript Buffer

RNase Inhibitor(40 U/μl)

PrimeScript Reverse Transcriptase(200 U/μl)

⑤ 42℃保温30分钟。

RNase free dH

2

O

使 用 量

10 μl

4 μl

0.5 μl

0.5 μl

up to 20 μl

使 用 量

1 μl

1 μl

1 μl

up to 10 μl

⑥ 70℃保温15分钟后冰上冷却,得到的cDNA溶液用于PCR扩增。

2.PCR反应

① 按下列组成配制PCR反应液,全量50 μl。

试剂名称

上述cDNA溶液

dNTP Mixture(2.5 mM each)

Forward Primer(10 μM)

Reverse Primer(10 μM)

10×LA PCR Buffer II(Mg

2+

Plus)

使 用 量

分别取1、2、5 μl

8 μl

1 μl

1 μl

5 μl

0.5 μl

up to 50 μl

94℃ 1 min

94℃ 30 sec

55℃ 30 sec

72℃ 5 min

72℃ 10 min

30 Cycles

TaKaRa LA Taq

(5 U/μl)

dH

2

O

② PCR反应条件如下:

-4-

3.RT-PCR扩增结果

PCR反应结束后,取5 μl的PCR反应液进行了琼脂糖凝胶电泳,结果如下。

M 1 2 3 M

M: 1 kbp DNA Ladder(TaKaRa Code:D517A)

1 : 1 μl cDNA溶液扩增结果

2 : 2 μl cDNA溶液扩增结果

3 : 5 μl cDNA溶液扩增结果

●使用本制品进行2 Step Real Time RT-PCR反应的实验例

本实验以Mouse Liver Total RNA为模板,使用2 Step Real Time RT-PCR方法,扩增Mouse GAPDH

基因。实验时,首先以Mouse Liver Total RNA为模板进行反转录反应,然后将得到的cDNA溶液使用

EASY Dilution按10倍梯度稀释,再将相当于1 pg~100 ng Total RNA量的cDNA作为模板,进行Real

,制作标准曲线。具体实验过程如下:

Time PCR扩增(使用了SYBR

®

Green I嵌合荧光法)

1.反转录反应

以Mouse Liver Total RNA为模板进行反转录反应。

① 按下列组成配制RT反应液(反应液请在冰上配制)。

试剂名称

5×PrimeScript Buffer

dNTP Mixture(10 mM each)

Random 6 mers (100 μM)*1

PrimeScript Reverse Transcriptase(200 U/μl)

RNase Inhibitor(40 U/μl)

Total RNA

RNase Free dH

2

O

使 用 量

2 μl

0.5 μl

0.5 μl

0.25 μl

0.25 μl

500 ng

up to 10 μl*2

*1 反转录引物可使用以下三种引物,使用量分别如下:

Random 6 mers(100 μM) 0.5 μl(50 pmol)

Oligo dT Primer(50 μM) 0.5 μl(25 pmol)

Specific Primer(2 μM) 0.5 μl(1 pmol)

*2 反应体积可按需求相应放大,10 μl的反应体系中Total RNA的最大使用量为500 ng。

② 反转录反应条件如下:

42℃ 10 min(反转录反应)

95℃ 2 min(反转录酶的失活反应)

2.Real Time PCR反应

Target:

Mouse GAPDH。

使用EASY Dilution(TaKaRa Code:D9160)将cDNA溶液按10

0

,10

1

,10

2

,10

3

10

4

,10

5

倍梯度稀释(10倍梯度稀释)后,各取2 μl进行Real Time PCR反应。此时

25 μl PCR反应液中的cDNA添加量分别相当于从100 ng,10 ng,1 ng,100 pg,10

pg,1 pg的Total RNA反转录得到的cDNA量。

Negative Control的模板使用了灭菌蒸馏水。

-5-

Template: Mouse Liver Total RNA经反转录反应后的cDNA溶液。

扩增长度:

使用仪器:

检测方法:

108 bp。

Smart Cycler System。

SYBR

®

Green I嵌合荧光法。

① 按下列组成配制Real Time PCR反应液(反应液请在冰上配制)。

PCR反应使用了SYBR

®

Premix Ex Taq

TM

(Perfect Real Time)(TaKaRa Code:DRR041)。

试剂名称

SYBR

®

Premix Ex Taq

TM

(2×)

PCR Forward Primer(10 μM)

PCR Reverse Primer(10 μM)

dH

2

O(灭菌蒸馏水)

Total Volume

释液。

* RT反应液(即各cDNA的梯度稀释液)的加入量不要超过Real Time PCR反应总体积的1/10(V/V)量。

③ 进行Real Time PCR反应,PCR反应条件如下:

95℃ 10 sec 1 Cycle

95℃ 5 sec

45 Cycles

60℃ 20 sec

④ Real Time PCR反应结果。

Real Time PCR扩增曲线图及融解曲线图如下:

使 用 量

12.5 μl

0.5 μl

0.5 μl

9.5 μl

23 μl

② 将上述PCR反应液加入至Real Time PCR用反应管中,然后再加入2 μl*的上述各cDNA的梯度稀

扩增曲线图 融解曲线图

反应结束后,根据扩增曲线的2nd derivative得到各扩增曲线的Ct值,制作标准曲线。

-6-

2nd derivative 标准曲线图

⑤ 结果分析。

本实验检测到了Mouse Liver Total RNA 1 pg~100 ng相当量的cDNA。分析融解曲线可知,无论

哪一种浓度的模板都能够得到单一的PCR扩增产物。同时标准曲线的线性关系良好,在实验浓度范围

内能够进行准确定量。

-7-

MEMO

-8-

-9-

技术咨询热线:

*************,87641686

8008909508,4006518769

宝生物工程(大连)有限公司

TaKaRa Biotechnology (Dalian) Co., Ltd.

辽宁省大连经济技术开发区东北二街19号(116600)

No.19 Dongbei 2nd Street, Development Zone, Dalian, China

电 话:*************87641683

传 真:*************87621675

:******************.cn

网 址:

V2010.06

本制品仅供研究用。请勿用于人体及动物的医疗、临床诊断或作为食品、化妆品、家庭用品的添加剂


本文标签: 反应 转录 进行 模板 扩增