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2024年12月29日发(作者:登录界面怎设计的好看)
TaKaRa Code:D2680A
®
PrimeScript
Reverse
Transcriptase
说明书
宝生物工程(大连)有限公司
目 录
内 容
●制品说明
●包 装
●保 存
●酶贮存溶液
●起 源
●活性定义
●纯 度
●用 途
●添附Buffer组成
●1st-Strand cDNA合成的实验操作方法
页 码
1
1
1
1
1
1
1
1
1
2
2
●使用Mouse Heart Total RNA进行RT-PCR反应的实验例
●使用HL60 Total RNA进行Human TFR基因(4.4 kbp)的
RT-PCR反应的实验例
●使用本制品进行2 Step Real Time RT-PCR反应的实验例
4
5
●制品说明
PrimeScript Reverse Transcriptase是TaKaRa公司独自开发的一种新型RNase H
-
型反转录酶。本酶具
有极强的延伸能力,能够有效地合成1st-strand cDNA,即使对有复杂二级结构的RNA,在42℃条件下
也能得到良好的反应效果,无需进行高温反转录反应,高温的反转录反应会导致RNA的降解。本酶适合于
长链cDNA的合成及高比例的全长cDNA文库的构建等。本酶具有以下特性:
z 超强的延伸能力
本反转录酶可以对10kb以上的RNA模板进行良好的反转录反应。
z 良好的反转录效率
本反转录酶可以对极少量的RNA模板进行良好的反转录反应。
z 复杂结构RNA的反转录性能
本反转录酶在标准的反转录温度条件下(42℃)对高GC含量的RNA模板能够进行良好的反转录反
应。
●包 装:
PrimeScript Reverse Transcriptase(200 U/μl)
5×PrimeScript Buffer
●保 存:
-20℃。
10,000 Units
500 μl
●酶贮存溶液
Tris-HCl(pH7.8)
NaCl
EDTA
DTT
Glycerol(V/V)
20mM
100mM
1.0mM
1.0mM
50%
●起 源:
Purified from an
strain expressing a recombinant enzyme
●活性定义
以Poly(rA)
·
Oligo(dT)为模板/引物,在37℃、10分钟条件下,掺入1 nmol的 [
3
H] dTTP所需要
的酶量定义为1个活性单位(U)。
●纯 度:
1) 200 U的本酶和1 μg的λDNA-
Hin
d III在37℃下反应1小时,DNA的电泳谱带不发生变化。
2) 200 U的本酶和1 μg的Supercoiled pBR322 DNA在37℃下反应1小时,DNA的电泳谱带不发
生变化。
3) 200 U的本酶和1 μg的16S,23S rRNA在37℃下反应1小时,RNA的电泳谱带不发生变化。
●用 途:
1) lst-Strand cDNA的合成。
2) cDNA Probe的制备。
3) 普通RT-PCR反应以及Real Time RT-PCR反应。
●添附Buffer组成(保存:-20℃)
5×PrimeScript Buffer(cDNA合成用)
Tris-HCl(pH8.3)
KCl
MgCl
2
-1-
250 mM
375 mM
15 mM
●1st-Strand cDNA合成的实验操作方法
1. 在Microtube管中配制下列混合液。
试剂名称
模板RNA
Oligo dT Primer(50 μM)
或Random Primers(50 μM)
或Specific Primer(2 μM)
dNTP Mixture (10 mM each)
RNase free dH
2
O
1 μl
up to 10 μl
1 μl
使 用 量
1 μg*
* Total RNA的使用量一般为5 μg以下;mRNA的使用量一般为1 μg以下。
2. 65℃保温5分钟后迅速在冰上急冷2分钟以上。
3. 离心数秒钟使模板RNA/引物等的混合液聚集于Microtube管底部。
4. 在上述Microtube管中配制下列反转录反应液。
试剂名称
上述模板RNA/引物等的混合液
5×PrimeScript Buffer
RNase Inhibitor(40 U/μl)
PrimeScript Reverse Transcriptase(200 U/μl)
RNase free dH
2
O
5. 30℃ 10 min*
42℃(~50℃) ** 30~60 min
* 以Random Primers作为反转录引物时应先进行30℃,10分钟反应。
** PrimeScript Reverse Transcriptase延伸能力强,通常情况下,即使模板RNA具有复杂的二级
结构,也可以在42℃下进行反转录反应。但当反转录引物使用PCR的下游引物时,由于引物错配
的原因等易发生非特异性反应,这时可以将反转录温度设为50℃。
6. 70℃保温15分钟后冰上冷却,得到的cDNA溶液可直接用于2nd-Strand cDNA的合成或者PCR
扩增等,PCR扩增时,cDNA溶液的使用量建议使用1~5 μl。
使 用 量
10 μl
4 μl
0. 5 μl
100~200 units
up to 20 μl
●使用Mouse Heart Total RNA进行RT-PCR反应的实验例
使用Mouse Heart Total RNA,分别进行RT-PCR反应,扩增了2 kbp、6 kbp、8 kbp和12 kbp的
目的DNA片段。
1.反转录反应
①
在Microtube管中配制下列混合液。
试剂名称
Mouse Heart Total RNA
Oligo dT
Primer(50 μM)
dNTP Mixture(10 mM each)
RNase free dH
2
O
② 65℃保温5分钟后迅速在冰上急冷2分钟以上。
③ 离心数秒钟使模板RNA/引物等的混合液聚集于Microtube管底部。
-2-
使 用 量
1 μl*
1 μl
1 μl
up to 10 μl
* Mouse Heart Total RNA使用量分别为1 μg、100 ng、10 ng。
④ 在上述Microtube管中配制下列反转录反应液。
试剂名称
上述模板RNA/引物等的混合液
5×PrimeScript Buffer
RNase Inhibitor(40 U/μl)
PrimeScript Reverse Transcriptase(200 U/μl)
RNase free dH
2
O
⑤ 42℃保温30分钟。
使 用 量
10 μl
4 μl
0.5 μl
0.5 μl
up to 20 μl
⑥ 70℃保温15分钟后冰上冷却,得到的cDNA溶液用于PCR扩增。
2.PCR反应
① 按下列组成配制PCR反应液,全量50 μl。
试剂名称
上述cDNA溶液
dNTP Mixture(2.5 mM each)
Forward Primer(10 μM)
Reverse Primer(10 μM)
10×LA PCR Buffer II(Mg
2+
Plus)
使 用 量
2 μl
8 μl
1 μl
1 μl
5 μl
0.5 μl
up to 50 μl
TaKaRa LA Taq
(5 U/μl)
dH
2
O
② PCR反应条件如下:
2 kbp、6 kbp、8 kbp、12 kbp的PCR反应条件
94℃ 1 min
98℃ 20 sec
68℃ 2/6/8/12 min
30 Cycles
72℃ 10 min
3.RT-PCR扩增结果
PCR反应结束后,取5 μl的PCR反应液进行了琼脂糖凝胶电泳,结果如下。
2kbp
6kbp 8kbp 12kbp
M3M
M: λ-
Hin
d III digest DNA Marker
1 : Total RNA 1 μg的RT-PCR扩增结
果
2 : Total RNA 100 ng的RT-PCR
扩增结果
3 : Total RNA 10 ng的RT-PCR扩增
结果
-3-
● 使用HL60 Total RNA进行Human TFR基因(4.4 kbp)的RT-PCR反应的实验例
1.反转录反应
① 在Microtube管中配制下列混合液。
试剂名称
HL60 Total RNA(100 ng/μl)
Oligo dT Primer(50 μM)
dNTP Mixture(10 mM each)
RNase free dH
2
O
② 65℃保温5分钟后迅速在冰上急冷2分钟以上。
③ 离心数秒钟使模板RNA/引物等的混合液聚集于Microtube管底部。
④ 在上述Microtube管中配制下列反转录反应液。
试剂名称
上述模板RNA/引物等的混合液
5×PrimeScript Buffer
RNase Inhibitor(40 U/μl)
PrimeScript Reverse Transcriptase(200 U/μl)
⑤ 42℃保温30分钟。
RNase free dH
2
O
使 用 量
10 μl
4 μl
0.5 μl
0.5 μl
up to 20 μl
使 用 量
1 μl
1 μl
1 μl
up to 10 μl
⑥ 70℃保温15分钟后冰上冷却,得到的cDNA溶液用于PCR扩增。
2.PCR反应
① 按下列组成配制PCR反应液,全量50 μl。
试剂名称
上述cDNA溶液
dNTP Mixture(2.5 mM each)
Forward Primer(10 μM)
Reverse Primer(10 μM)
10×LA PCR Buffer II(Mg
2+
Plus)
使 用 量
分别取1、2、5 μl
8 μl
1 μl
1 μl
5 μl
0.5 μl
up to 50 μl
94℃ 1 min
94℃ 30 sec
55℃ 30 sec
72℃ 5 min
72℃ 10 min
30 Cycles
TaKaRa LA Taq
(5 U/μl)
dH
2
O
② PCR反应条件如下:
-4-
3.RT-PCR扩增结果
PCR反应结束后,取5 μl的PCR反应液进行了琼脂糖凝胶电泳,结果如下。
M 1 2 3 M
M: 1 kbp DNA Ladder(TaKaRa Code:D517A)
1 : 1 μl cDNA溶液扩增结果
2 : 2 μl cDNA溶液扩增结果
3 : 5 μl cDNA溶液扩增结果
●使用本制品进行2 Step Real Time RT-PCR反应的实验例
本实验以Mouse Liver Total RNA为模板,使用2 Step Real Time RT-PCR方法,扩增Mouse GAPDH
基因。实验时,首先以Mouse Liver Total RNA为模板进行反转录反应,然后将得到的cDNA溶液使用
EASY Dilution按10倍梯度稀释,再将相当于1 pg~100 ng Total RNA量的cDNA作为模板,进行Real
,制作标准曲线。具体实验过程如下:
Time PCR扩增(使用了SYBR
®
Green I嵌合荧光法)
1.反转录反应
以Mouse Liver Total RNA为模板进行反转录反应。
① 按下列组成配制RT反应液(反应液请在冰上配制)。
试剂名称
5×PrimeScript Buffer
dNTP Mixture(10 mM each)
Random 6 mers (100 μM)*1
PrimeScript Reverse Transcriptase(200 U/μl)
RNase Inhibitor(40 U/μl)
Total RNA
RNase Free dH
2
O
使 用 量
2 μl
0.5 μl
0.5 μl
0.25 μl
0.25 μl
500 ng
up to 10 μl*2
*1 反转录引物可使用以下三种引物,使用量分别如下:
Random 6 mers(100 μM) 0.5 μl(50 pmol)
Oligo dT Primer(50 μM) 0.5 μl(25 pmol)
Specific Primer(2 μM) 0.5 μl(1 pmol)
*2 反应体积可按需求相应放大,10 μl的反应体系中Total RNA的最大使用量为500 ng。
② 反转录反应条件如下:
42℃ 10 min(反转录反应)
95℃ 2 min(反转录酶的失活反应)
2.Real Time PCR反应
Target:
Mouse GAPDH。
使用EASY Dilution(TaKaRa Code:D9160)将cDNA溶液按10
0
,10
1
,10
2
,10
3
,
10
4
,10
5
倍梯度稀释(10倍梯度稀释)后,各取2 μl进行Real Time PCR反应。此时
25 μl PCR反应液中的cDNA添加量分别相当于从100 ng,10 ng,1 ng,100 pg,10
pg,1 pg的Total RNA反转录得到的cDNA量。
Negative Control的模板使用了灭菌蒸馏水。
-5-
Template: Mouse Liver Total RNA经反转录反应后的cDNA溶液。
扩增长度:
使用仪器:
检测方法:
108 bp。
Smart Cycler System。
SYBR
®
Green I嵌合荧光法。
① 按下列组成配制Real Time PCR反应液(反应液请在冰上配制)。
PCR反应使用了SYBR
®
Premix Ex Taq
TM
(Perfect Real Time)(TaKaRa Code:DRR041)。
试剂名称
SYBR
®
Premix Ex Taq
TM
(2×)
PCR Forward Primer(10 μM)
PCR Reverse Primer(10 μM)
dH
2
O(灭菌蒸馏水)
Total Volume
释液。
* RT反应液(即各cDNA的梯度稀释液)的加入量不要超过Real Time PCR反应总体积的1/10(V/V)量。
③ 进行Real Time PCR反应,PCR反应条件如下:
95℃ 10 sec 1 Cycle
95℃ 5 sec
45 Cycles
60℃ 20 sec
④ Real Time PCR反应结果。
Real Time PCR扩增曲线图及融解曲线图如下:
使 用 量
12.5 μl
0.5 μl
0.5 μl
9.5 μl
23 μl
② 将上述PCR反应液加入至Real Time PCR用反应管中,然后再加入2 μl*的上述各cDNA的梯度稀
扩增曲线图 融解曲线图
反应结束后,根据扩增曲线的2nd derivative得到各扩增曲线的Ct值,制作标准曲线。
-6-
2nd derivative 标准曲线图
⑤ 结果分析。
本实验检测到了Mouse Liver Total RNA 1 pg~100 ng相当量的cDNA。分析融解曲线可知,无论
哪一种浓度的模板都能够得到单一的PCR扩增产物。同时标准曲线的线性关系良好,在实验浓度范围
内能够进行准确定量。
-7-
MEMO
-8-
-9-
技术咨询热线:
*************,87641686
8008909508,4006518769
宝生物工程(大连)有限公司
TaKaRa Biotechnology (Dalian) Co., Ltd.
辽宁省大连经济技术开发区东北二街19号(116600)
No.19 Dongbei 2nd Street, Development Zone, Dalian, China
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:******************.cn
网 址:
V2010.06
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