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2024年5月1日发(作者：教你如何建设网站)

NBCI介绍与使用方法

2012-02-25 21:35:32| 分类： 书籍 学术 | 标签：nbci blast 基因组 测序 dna |

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NCBI (National Center for Biotechnology Information), 美国国家生物技术信息

中心

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NCBI是NIH的国立医学图书馆（NLM）的一个分支。

NCBI提供检索的服务包括：

1．GenBank（NIH遗传序列数据库）：一个可以公开获得所有的DNA序列的注释过

的收集。GenBank是由NCBI受过分子生物学高级训练的工作人员通过来自各个实验室递

交的序列和同国际核酸序列数据库（EMBL和DDBJ）交换数据建立起数据库的。它同日

本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。这三个

组织每天交换数据。其中的数据以指数形式增长，最近的数据为它已经有来自47000个物

种的30亿个碱基。

2．Molecular Databases（分子数据库）：

Nucleotide Sequence（核酸序列库）：从NCBI其他如Genbank数据库中收集整理

核酸序列，提供直接的检索。

Protein Sequence （蛋白质序列库）：与核酸类似，也是从NCBI多个不同资源中编

译整理的，方便研究者的直接查询。

Structure（结构）-—— 关于NCBI结构小组的一般信息和他们的研究计划，另外也

可以访问三维蛋白质结构的分子模型数据库（MMDB）和用来搜索和显示结构的相关工具。

MMDB：分子模型数据库 — 一个关于三维生物分子结构的数据库，结构来自于X-ray晶

体衍射和NMR色谱分析。

Taxonomy（分类学）——NCBI的分类数据库，包括大于7万余个物种的名字和种

系，这些物种都至少在遗传数据库中有一条核酸或蛋白序列。其目的是为序列数据库建立

一个一致的种系发生分类学。

3．Literature Databases（文献数据库）

（1）PubMed是NLM提供的一项服务，能够对MEDLINE上超过1200万条的上世

纪六十年代中期至今的杂志引用和其他的生命科学期刊进行访问，并可以连接到参与的出

版商网络站点的全文文章和其他相关资源。

（2）PMC/PubMed Center：也是NLM的生命科学期刊文献的数字化存储数据库，

用户可以免费获取PMC的文章全文，除了部分期刊要求对近期的文章付费。

（3）OMIM（孟德尔人类遗传）：有关人类基因和无序基因的目录数据库由Victor

ck和他的同事共同创造和编辑的，由NCBI网站负责开发，其中也包括对

MEDINE众多资源和Entrez系统的序列记录，以及NCBI中其他有关资源的链接。


本文标签： 数据库 序列 结构 核酸 文章

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