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2024年5月1日发(作者:php会被淘汰吗)
NCBI的检索
NCBI包括五个部分,第一部分是欢迎进入NCBI,包括NCBI的最新信息、计划与活
动、读者来信、服务地址和用户评论等。第二部分是基因序列数据库(GenBank),包括基
因库概述、检索与投稿。第三部分是数据库服务,包括免费的PubMed检索、Entrez检
索、BLAST序列族性检索、电子邮件服务(详见本章第四节)、匿名FTP服务。第四部分
是NCBI的其它资源。
GenBank的检索
在NCBI主页的第二部分点击“Searching GenBank”,即可进入GenBank的检索屏
幕。NCBI•提供了五种检索,即Entrez浏览检索、BLAST序列类似性检索、dbEST检索、
dbSTS•检索和文本检索(Text Searching)。
一、Entrez浏览检索
检索的数据库及其检索信息
Entrez浏览器(Entrez Browser)可以检索以下与NCBI•链接的基因序列数据库的分子
生物数据和书目文献资料。
••••(1) GenBank、EMBL、DDBJ中的DNA序列;
••••(2) SWISS-PROT、PIR、PRF、PDB中的蛋白质序列以及DNA序列数据库中翻译
的蛋白质序列;
••••(3) 基因和染色体图像数据;
••••(4) PDB以及收入NCBI分子模型数据库(MMDB)的蛋白质三维结构;
••••(5) 通过PubMed检索Medline和PreMedline数据库。
••••检索功能
••••Entrez提供了以下三种检索功能。
••••(1)自由词检索功能
••••用户可以通过文本词、关键词、截词、期刊名或文献的作者检索Entrez数据库。截
词用*号,期刊名必须用Medline刊名缩写,作者姓名必须是姓在前,名在后,用首字母
缩写。
••••(2)索引词表(List Terms)检索功能
••••索引词表检索是当你键入检索词,Entrez•在你选定的字段中显示从该检索词开始的
一个索引词表窗口,这时,你可以选择一个或几个词进行检索,这对单词拼写不准确时非
常有用。•例如:在输入框中键入“P53”,选择文本字段(Text Words)和索引词表(List Terms)•
检索功能,再点击“Search”,这时返回一个以“P53”开始的索引词表窗口,浏览选择一
个或几个索引词,点击“Search”,Entrez将返回检索结果。
••••(3)自动检索功能
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