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2024年5月1日发(作者:php会被淘汰吗)

NCBI的检索

NCBI包括五个部分,第一部分是欢迎进入NCBI,包括NCBI的最新信息、计划与活

动、读者来信、服务地址和用户评论等。第二部分是基因序列数据库(GenBank),包括基

因库概述、检索与投稿。第三部分是数据库服务,包括免费的PubMed检索、Entrez检

索、BLAST序列族性检索、电子邮件服务(详见本章第四节)、匿名FTP服务。第四部分

是NCBI的其它资源。

GenBank的检索

在NCBI主页的第二部分点击“Searching GenBank”,即可进入GenBank的检索屏

幕。NCBI•提供了五种检索,即Entrez浏览检索、BLAST序列类似性检索、dbEST检索、

dbSTS•检索和文本检索(Text Searching)。

一、Entrez浏览检索

检索的数据库及其检索信息

Entrez浏览器(Entrez Browser)可以检索以下与NCBI•链接的基因序列数据库的分子

生物数据和书目文献资料。

••••(1) GenBank、EMBL、DDBJ中的DNA序列;

••••(2) SWISS-PROT、PIR、PRF、PDB中的蛋白质序列以及DNA序列数据库中翻译

的蛋白质序列;

••••(3) 基因和染色体图像数据;

••••(4) PDB以及收入NCBI分子模型数据库(MMDB)的蛋白质三维结构;

••••(5) 通过PubMed检索Medline和PreMedline数据库。

••••检索功能

••••Entrez提供了以下三种检索功能。

••••(1)自由词检索功能

••••用户可以通过文本词、关键词、截词、期刊名或文献的作者检索Entrez数据库。截

词用*号,期刊名必须用Medline刊名缩写,作者姓名必须是姓在前,名在后,用首字母

缩写。

••••(2)索引词表(List Terms)检索功能

••••索引词表检索是当你键入检索词,Entrez•在你选定的字段中显示从该检索词开始的

一个索引词表窗口,这时,你可以选择一个或几个词进行检索,这对单词拼写不准确时非

常有用。•例如:在输入框中键入“P53”,选择文本字段(Text Words)和索引词表(List Terms)•

检索功能,再点击“Search”,这时返回一个以“P53”开始的索引词表窗口,浏览选择一

个或几个索引词,点击“Search”,Entrez将返回检索结果。

••••(3)自动检索功能


本文标签: 检索 数据库 序列 部分 服务