admin 管理员组文章数量: 1086019
2024年5月1日发(作者:个人博客杨青青模板)
如何在ncbi上检索 NCBI包括五个部分,第一部分是欢迎进入NCBI,包括NCBI的
最新信息、计划与活动、读者来信、服务地址和用户评论等。第二部分是基因序列数据库
(GenBank),包括基因库概述、检索与投稿。第三部分是数据库服务,包括免费的PubMed
检索、Entrez检索、BLAST序列族性检索、电子邮件服务(详见本章第四节)、匿名FTP服
务。第四部分是NCBI的其它资源。 GenBank的检索 在NCBI主页的第二部分点击
"Searching GenBank",即可进入GenBank的检索屏幕。NCBI•提供了五种检索,即Entrez
浏览检索、BLAST序列类似性检索、dbEST检索、dbSTS•检索和文本检索(Text Searching)。
一、Entrez浏览检索 检索的数据库及其检索信息 Entrez浏览器(Entrez Browser)
可以检索以下与NCBI•链接的基因序列数据库的分子生物数据和书目文献资料。 ••••
(1) GenBank、EMBL、DDBJ中的DNA序列; ••••
(2) SWISS-PROT、PIR、PRF、PDB中的蛋白质序列以及DNA序列数据库中翻译的
蛋白质序列; ••••
(3) 基因和染色体图像数据; ••••
(4) PDB以及收入NCBI分子模型数据库(MMDB)的蛋白质三维结构; ••••
(5) 通过PubMed检索Medline和PreMedline数据库。 ••••
检索功能 ••••
Entrez提供了以下三种检索功能。
•• (1)自由词检索功能 •••
用户可以通过文本词、关键词、截词、期刊名或文献的作者检索Entrez数据库。截词
用*号,期刊名必须用Medline刊名缩写,作者姓名必须是姓在前,名在后,用首字母缩
写。
••••(2)索引词表(List Terms)检索功能
••••索引词表检索是当你键入检索词,Entrez•在你选定的字段中显示从该检索词开始的
一个索引词表窗口,这时,你可以选择一个或几个词进行检索,这对单词拼写不准确时非
常有用。•例如:在输入框中键入"P53",选择文本字段(Text Words)和索引词表(List Terms)•
检索功能,再点击"Search",这时返回一个以"P53"开始的索引词表窗口,浏览选择一个
或几个索引词,点击"Search",Entrez将返回检索结果。
••••(3)自动检索功能
••••自动检索功能就是Entrez浏览器根据用户输入的检索式自动进行检索,返回当前检
索式检出的文献数,如满意,可进一步取得检索结果,如不满意,则可对当前检索式进行
修改,直到用户满意为此。例如在输入框键入"P53",•选择所有字段和自动检索功能,•点
击"•Search•",•Entrez返回一个Web页,包括当前检出文献数、加词检索和修改当前检
索三个部分。如果你对检出文献数不满意(过多或过少),可以在加词检索部分增加更专指
的检索词,以提高查准率,也可以在修改当前检索部分选择某一布尔算符(AND、OR、NOT、
ANDNOT),对当前的检索策略进行修改,直到你满意为止。
••••对于检出文献,用户可以选择浏览格式进行浏览,也可以打印或存盘。
••••3 Entrez检索规则
版权声明:本文标题:如何在ncbi上检索 内容由网友自发贡献,该文观点仅代表作者本人, 转载请联系作者并注明出处:http://roclinux.cn/p/1714517732a683504.html, 本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌抄袭侵权/违法违规的内容,一经查实,本站将立刻删除。
发表评论