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2024年5月1日发(作者:个人博客杨青青模板)

如何在ncbi上检索 NCBI包括五个部分,第一部分是欢迎进入NCBI,包括NCBI的

最新信息、计划与活动、读者来信、服务地址和用户评论等。第二部分是基因序列数据库

(GenBank),包括基因库概述、检索与投稿。第三部分是数据库服务,包括免费的PubMed

检索、Entrez检索、BLAST序列族性检索、电子邮件服务(详见本章第四节)、匿名FTP服

务。第四部分是NCBI的其它资源。 GenBank的检索 在NCBI主页的第二部分点击

"Searching GenBank",即可进入GenBank的检索屏幕。NCBI•提供了五种检索,即Entrez

浏览检索、BLAST序列类似性检索、dbEST检索、dbSTS•检索和文本检索(Text Searching)。

一、Entrez浏览检索 检索的数据库及其检索信息 Entrez浏览器(Entrez Browser)

可以检索以下与NCBI•链接的基因序列数据库的分子生物数据和书目文献资料。 ••••

(1) GenBank、EMBL、DDBJ中的DNA序列; ••••

(2) SWISS-PROT、PIR、PRF、PDB中的蛋白质序列以及DNA序列数据库中翻译的

蛋白质序列; ••••

(3) 基因和染色体图像数据; ••••

(4) PDB以及收入NCBI分子模型数据库(MMDB)的蛋白质三维结构; ••••

(5) 通过PubMed检索Medline和PreMedline数据库。 ••••

检索功能 ••••

Entrez提供了以下三种检索功能。

•• (1)自由词检索功能 •••

用户可以通过文本词、关键词、截词、期刊名或文献的作者检索Entrez数据库。截词

用*号,期刊名必须用Medline刊名缩写,作者姓名必须是姓在前,名在后,用首字母缩

写。

••••(2)索引词表(List Terms)检索功能

••••索引词表检索是当你键入检索词,Entrez•在你选定的字段中显示从该检索词开始的

一个索引词表窗口,这时,你可以选择一个或几个词进行检索,这对单词拼写不准确时非

常有用。•例如:在输入框中键入"P53",选择文本字段(Text Words)和索引词表(List Terms)•

检索功能,再点击"Search",这时返回一个以"P53"开始的索引词表窗口,浏览选择一个

或几个索引词,点击"Search",Entrez将返回检索结果。

••••(3)自动检索功能

••••自动检索功能就是Entrez浏览器根据用户输入的检索式自动进行检索,返回当前检

索式检出的文献数,如满意,可进一步取得检索结果,如不满意,则可对当前检索式进行

修改,直到用户满意为此。例如在输入框键入"P53",•选择所有字段和自动检索功能,•点

击"•Search•",•Entrez返回一个Web页,包括当前检出文献数、加词检索和修改当前检

索三个部分。如果你对检出文献数不满意(过多或过少),可以在加词检索部分增加更专指

的检索词,以提高查准率,也可以在修改当前检索部分选择某一布尔算符(AND、OR、NOT、

ANDNOT),对当前的检索策略进行修改,直到你满意为止。

••••对于检出文献,用户可以选择浏览格式进行浏览,也可以打印或存盘。

••••3 Entrez检索规则


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