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2024年4月15日发(作者:以下关于时间轴特效)
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GUASSIAN中的NBO计算结果分析
在任务控制行中加上“Pop=nbo”关键词,可对分子进行全面的自然键轨道分析,如果
添加的关键词为“Pop=NPA”,则只产生自然布居分析数据。
以C
2v
对称的甲醛分子为例,说明NBO计算输出文件的各相关信息的意义。
输入文件内容为:
#P HF/STO-3G scf=tight pop=nbo
HF/STO-3G//HF/STO-3G sp formaldehyde
0 1
C1
O2 1 r2
H3 1 r3 2 a3
H4 1 r3 2 a3 3 180.0
r2=1.21672286
r3=1.10137241
a3=122.73666566
计算结束后,用文本编辑器打开对应的输出文件,查找“Gaussian NBO”,可看到相
应的计算结果。主要有以下几部分重要的信息:
第一部分显示的是分子中各自然原子轨道占据状况。
NATURAL POPULATIONS: Natural atomic orbital occupancies
NAO Atom No lang Type(AO) Occupancy Energy
---------------------------------------------------------
1 C 1 s Cor( 1s) 2.00000 -11.05947
2 C 1 s Val( 2s) 1.08461 -0.26145
3 C 1 px Val( 2p) 0.90165 -0.04494
4 C 1 py Val( 2p) 0.99304 0.07032
5 C 1 pz Val( 2p) 0.85379 0.14739
6 O 2 s Cor( 1s) 1.99999 -20.15602
7 O 2 s Val( 2s) 1.79982 -1.09031
8 O 2 px Val( 2p) 1.09835 -0.11626
9 O 2 py Val( 2p) 1.91857 -0.38126
10 O 2 pz Val( 2p) 1.37055 -0.15404
11 H 3 s Val( 1s) 0.98982 0.02250
12 H 4 s Val( 1s) 0.98982 0.02250
第一列为原子轨道编号;第二列为原子符号;第三列为原子在分子结构中的编号;第
四列“Lang”为原子的角量子数符号;第五列为原子轨道的类型,其中“Cor”指内层轨道
(不参与成键),“Val”指价轨道,“Ryd”指激发态高能级轨道;第六列为轨道中占据
的电子数;第七列为轨道的能量高低,即能级。
接下来的第二部分为自然布居分析结果。
Summary of Natural Population Analysis:
Natural Population
1
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Natural -----------------------------------------------
Atom No Charge Core Valence Rydberg Total
-----------------------------------------------------------------------
C 1 0.16692 2.00000 3.83308 0.00000 5.83308
O 2 -0.18728 1.99999 6.18729 0.00000 8.18728
H 3 0.01018 0.00000 0.98982 0.00000 0.98982
H 4 0.01018 0.00000 0.98982 0.00000 0.98982
=======================================================================
* Total * 0.00000 3.99999 12.00001 0.00000 16.00000
从上面的数据中,可以看到每个原子上的自然电荷分布情况和该原子中各类轨道的电子
占据状况。
Natural Population
--------------------------------------------------------
Core 3.99999 ( 99.9997% of 4)
Valence 12.00001 (100.0001% of 12)
Natural Minimal Basis 16.00000 (100.0000% of 16)
Natural Rydberg Basis 0.00000 ( 0.0000% of 16)
--------------------------------------------------------
以上列出的是各类轨道电子占据的汇总情况。其中内层轨道有4个电子,价轨道有12
个电子,基态电子共有16个,没有激发态电子。
Atom No Natural Electron Configuration
----------------------------------------------------------------------------
C 1 [core]2s( 1.08)2p( 2.75)
O 2 [core]2s( 1.80)2p( 4.39)
H 3 1s( 0.99)
H 4 1s( 0.99)
----------------------------------------------------------------------------
以上给出的是每个原子的电子构型。
第三部分为分子的Lewis电子结构分析结果。
NATURAL BOND ORBITAL ANALYSIS:
Occupancies Lewis Structure Low High
Occ. ----------------- --------------- occ occ
Cycle Thresh. Lewis Non-Lewis CR BD 3C LP (L) (NL) Dev
===================================================================
1(1) 1.90 15.90533 0.09467 2 4 0 2 0 0 0.04
Structure accepted: No low occupancy Lewis orbitals
Core 3.99999 (100.000% of 4)
Valence Lewis 11.90534 ( 99.211% of 12)
================== ============================
Total Lewis 15.90533 ( 99.408% of 16)
Valence non-Lewis 0.09467 ( 0.592% of 16)
Rydberg non-Lewis 0.00000 ( 0.000% of 16)
================== ============================
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